-S option implemented: works only on the given strand (still not implemented for... master
treeb0442767d9b0b165069ef8d6823f294a23566ae5
-rw-r--r-- 297 .gitignore
-rw-r--r-- 7682 CuTest.c
-rw-r--r-- 3959 CuTest.h
drwxr-xr-x - Data
-rw-r--r-- 1032 all_tests.c
-rw-r--r-- 1510 debug.c
drwxr-xr-x - examples
-rw-r--r-- 12154 fasta.c
-rw-r--r-- 13486 input.c
-rw-r--r-- 6865 main.c
-rw-r--r-- 489 makefile
-rw-r--r-- 2531 matrix_rider.mdp
-rw-r--r-- 611 matrix_rider.mds
-rwxr-xr-x 1320 matrix_rider.userprefs
-rw-r--r-- 23060 matrixes.c
-rw-r--r-- 7902 tests.c
drwxr-xr-x - tests
-rw-r--r-- 8195 total_affinity.h