modified: SpatialOmicsCoord.py
[GalaxyCodeBases.git] / c_cpp / etc / KaKs_Calculator / examples / example.axt.kaks
blobecd786441b37bb1e8bed7d8b32ef62e06a843b44
1 Sequence        Method  Ka      Ks      Ka/Ks   P-Value(Fisher) Length  S-Sites N-Sites Fold-Sites(0:2:4)       Substitutions   S-Substitutions N-Substitutions Fold-S-Substitutions(0:2:4)     Fold-N-Substitutions(0:2:4)     Divergence-Time Substitution-Rate-Ratio(rTC:rAG:rTA:rCG:rTG:rCA/rCA)    GC(1:2:3)       ML-Score        AICc    Akaike-Weight   Model\r
2 NP_000005.1     MLWL    0.177894        0.617911        0.287895        4.33945e-164    4371    1141.33 3229.67 2824.5:822:724.5        982     705.238 574.539 253.667:178.5:161.5     181.583:74.75:132       0.292788        3.05751:3.05751:1:1:1:1 0.490709(0.545887:0.381373:0.544867)    NA      NA      NA      NA\r
3 NP_000005.1     LPB     0.183309        0.571351        0.320834        7.2407e-135     4371    1220.51 3167.7  2824.5:822:724.5        982     697.342 580.668 256.833:173.75:161.5    178.417:79.5:132        0.292384        3.03697:3.03697:1:1:1:1 0.490709(0.545887:0.381373:0.544867)    NA      NA      NA      NA\r
4 NP_000005.1     MS      0.184389        0.691942        0.266481        5.03294e-126    4371    1219.25 3151.75 NA      982     581.462 400.538 NA      NA      0.325967        2.21445:3.15799:0.793023:0.793023:1:1   0.490709(0.545887:0.381373:0.544867)    -8840.48        17691   0.482797        TIM\r
5 NP_000005.1     MA      0.183941        0.689886        0.266626        6.08122e-126    4371    1225.7  3145.3  NA      982     583.067 398.933 NA      NA      0.325816        2.34059:3.3184:0.816384:0.825478:1.01626:1      0.490709(0.545887:0.381373:0.544867)    -8840.56        NA      NA      NA\r
6 NP_000006.1     MLWL    0.169695        0.588374        0.288413        1.26587e-030    870     216.015 653.985 558.5:199.5:112 186     127.097 110.978 44.6667:44.1667:25.3333 39.5:15.1667:17.1667    0.27365 3.17865:3.17865:1:1:1:1 0.422989(0.468966:0.32931:0.47069)      NA      NA      NA      NA\r
7 NP_000006.1     LPB     0.178353        0.500956        0.356025        6.83272e-021    870     238.608 653.979 558.5:199.5:112 186     119.532 116.639 44.6667:39.5:25.3333    39.5:19.8333:17.1667    0.271461        2.86275:2.86275:1:1:1:1 0.422989(0.468966:0.32931:0.47069)      NA      NA      NA      NA\r
8 NP_000006.1     MS      0.185188        0.648067        0.285754        2.75329e-022    870     207.343 662.657 NA      186     97.2166 88.7834 NA      NA      0.295504        1.7127:1.7127:1.7127:1.7127:0.193852:1  0.422989(0.468966:0.32931:0.47069)      -1758.63        3529.56 0.736798        TVM\r
9 NP_000006.1     MA      0.184011        0.644579        0.285475        1.36458e-022    870     210.525 659.475 NA      186     98.1915 87.8085 NA      NA      0.29546 1.70827:1.72238:1.31724:1.6192:0.301166:1       0.422989(0.468966:0.32931:0.47069)      -1773.64        NA      NA      NA\r
10 NP_000008.1     MLWL    0.0547625       0.478688        0.114401        8.88497e-063    1236    326     910     801.5:217:217.5 165     156.052 49.8339 18.4167:46.75:33.8333   24.3333:5.33333:36.3333 0.166575        3:3:1:1:1:1     0.60801(0.595874:0.468447:0.759709)     NA      NA      NA      NA\r
11 NP_000008.1     LPB     0.0556092       0.455712        0.122027        4.89333e-058    1236    337.689 924.722 801.5:217:217.5 165     153.889 51.423  18.4167:45.25:33.8333   24.3333:6.83333:36.3333 0.16611 2.88889:2.88889:1:1:1:1 0.60801(0.595874:0.468447:0.759709)     NA      NA      NA      NA\r
12 NP_000008.1     MS      0.0503831       0.711024        0.07086 4.02013e-070    1236    260.626 975.374 NA      165     130.415 34.5846 NA      NA      0.189687        1.82319:1.82319:1.82319:1.82319:1:1     0.60801(0.595874:0.468447:0.759709)     -2158.2 4324.5  0.514141        K3PUF\r
13 NP_000008.1     MA      0.0501752       0.706062        0.0710635       1.91584e-069    1236    263.003 972.997 NA      165     130.651 34.3487 NA      NA      0.189739        1.97746:2.00684:1.48303:1.48885:0.640607:1      0.60801(0.595874:0.468447:0.759709)     -2169.91        NA      NA      NA\r