c_cpp/etc/jellyfish/configure.ac

   1 AC_INIT([jellyfish], [1.1.4], [gmarcais@umd.edu])
   2 AC_CANONICAL_HOST
   3 AC_CONFIG_MACRO_DIR([m4])
   4 AM_INIT_AUTOMAKE([-Wall -Werror subdir-objects foreign parallel-tests color-tests])
   5 AM_SILENT_RULES([yes])
   6
   7 : ${CXXFLAGS=""}
   8 AC_PROG_CXX
   9
  10 AC_CONFIG_MACRO_DIR([m4])
  11 AC_CONFIG_HEADERS([config.h])
  12
  13 dnl define([concat], $1$2$3)dnl
  14 dnl define([PC_FILE], concat([jellyfish-],AC_PACKAGE_VERSION,[.pc]))
  15 define([PC_FILE], jellyfish-1.1.pc)
  16 AC_CONFIG_FILES([
  17     Makefile
  18     tests/compat.sh
  19 ]
  20     PC_FILE
  21 )
  22
  23 AC_ARG_VAR([MD5], [Path to md5 hashing program])
  24 AS_IF([test "x$MD5" = "x"], AC_CHECK_PROG([MD5], [md5sum], [md5sum]), [])
  25 AS_IF([test "x$MD5" = "x"], AC_CHECK_PROG([MD5], [md5], [md5 -r]), [])
  26 AS_IF([test "x$MD5" = "x"], AC_MSG_ERROR([Could not find md5 hashing program in your path]), [])
  27
  28 AC_ARG_WITH([sse],
  29             [AS_HELP_STRING([--with-sse], [enable SSE])],
  30             [], [with_sse=no])
  31 AS_IF([test "x$with_sse" != xno],
  32       [AC_DEFINE([HAVE_SSE], [1], [Define if you have SSE])],
  33       [])
  34
  35 AC_ARG_WITH([half],
  36             [AS_HELP_STRING([--with-half], [enable half float (16 bits)])],
  37             [], [with_half=no])
  38 AS_IF([test "x$with_half" = "xyes"],
  39       [AC_DEFINE([HALF_FLOATS], [1], [Define if you use half floats for qmer counting])],
  40       [])
  41
  42 # Check the version of strerror_r
  43 AC_FUNC_STRERROR_R
  44
  45 AC_CHECK_HEADERS([execinfo.h])
  46
  47 AC_CHECK_MEMBER([siginfo_t.si_int],
  48                 [AC_DEFINE([HAVE_SI_INT], [1], [Define if siginfo_t.si_int exists])],
  49                 [], [[#include <signal.h>]])
  50
  51 LT_INIT
  52 AC_OUTPUT
  53
  54