c_cpp/lib/htslib/test/c1#unknown.sam

   1 @SQ     SN:c1   LN:10
   2 @CO     Tests permuations of seq / qual being present or "*" in mapped
   3 @CO     and unmapped forms.  Also tests MD/NM tag generation.
   4 _sqm    0       c1      1       0       2M1I4M1D3M      *       0       0       AACCCTCGTT      IIIIIIIIII      MD:Z:4G1^G3     NM:i:3
   5 _sm     0       c1      1       0       2M1I4M1D3M      *       0       0       AACCCTCGTT      *       MD:Z:4G1^G3     NM:i:3
   6 _m      0       c1      1       0       2M1I4M1D3M      *       0       0       *       *       MD:Z:4G1^G3     NM:i:3
   7 _squ    4       c1      1       0       *       *       0       0       AACCCTCGTT      IIIIIIIIII
   8 _su     4       c1      1       0       *       *       0       0       AACCCTCGTT      *
   9 _u      4       c1      1       0       *       *       0       0       *       *