pkgs/by-name/in/inormalize/package.nix

   1 { lib, stdenv, fetchFromGitHub, cmake, makeWrapper,
   2   perlPackages,
   3   libminc, ebtks }:
   4
   5 stdenv.mkDerivation rec {
   6   pname = "inormalize";
   7   version  = "unstable-2014-10-21";
   8
   9   src = fetchFromGitHub {
  10     owner  = "BIC-MNI";
  11     repo   = pname;
  12     rev    = "79cea9cdfe7b99abfd40afda89ab2253b596ad2f";
  13     sha256 = "1ahqv5q0ljvji99a5q8azjkdf6bgp6nr8lwivkqwqs3jm0k5clq7";
  14   };
  15
  16   patches = [ ./lgmask-interp.patch ./nu_correct_norm-interp.patch ];
  17
  18   postPatch = ''
  19     substituteInPlace inormalize.cc \
  20       --replace "clamp" "::clamp"
  21   '';
  22
  23   nativeBuildInputs = [ cmake makeWrapper ];
  24   buildInputs = [ libminc ebtks ];
  25   propagatedBuildInputs = with perlPackages; [ perl GetoptTabular MNI-Perllib ];
  26
  27   cmakeFlags = [ "-DLIBMINC_DIR=${libminc}/lib/cmake" "-DEBTKS_DIR=${ebtks}/lib/" ];
  28
  29   postFixup = ''
  30     for p in $out/bin/*; do
  31       wrapProgram $p --prefix PERL5LIB : $PERL5LIB
  32     done
  33   '';
  34
  35   meta = with lib; {
  36     homepage = "https://github.com/BIC-MNI/${pname}";
  37     description = "Program to normalize intensity of MINC files";
  38     maintainers = with maintainers; [ bcdarwin ];
  39     platforms = platforms.unix;
  40     license   = licenses.free;
  41   };
  42 }