pkgs/development/python-modules/cython/0.nix

   1 {
   2   lib,
   3   stdenv,
   4   buildPythonPackage,
   5   fetchPypi,
   6   fetchpatch,
   7   setuptools,
   8   python,
   9   pkg-config,
  10   gdb,
  11   numpy,
  12   ncurses,
  13 }:
  14
  15 let
  16   excludedTests =
  17     [ "reimport_from_subinterpreter" ]
  18     # cython's testsuite is not working very well with libc++
  19     # We are however optimistic about things outside of testsuite still working
  20     ++ lib.optionals (stdenv.cc.isClang or false) [
  21       "cpdef_extern_func"
  22       "libcpp_algo"
  23     ]
  24     # Some tests in the test suite isn't working on aarch64. Disable them for
  25     # now until upstream finds a workaround.
  26     # Upstream issue here: https://github.com/cython/cython/issues/2308
  27     ++ lib.optionals stdenv.hostPlatform.isAarch64 [ "numpy_memoryview" ]
  28     ++ lib.optionals stdenv.hostPlatform.isi686 [
  29       "future_division"
  30       "overflow_check_longlong"
  31     ];
  32 in
  33 buildPythonPackage rec {
  34   pname = "cython";
  35   version = "0.29.36";
  36   pyproject = true;
  37
  38   src = fetchPypi {
  39     pname = "Cython";
  40     inherit version;
  41     hash = "sha256-QcDP0tdU44PJ7rle/8mqSrhH0Ml0cHfd18Dctow7wB8=";
  42   };
  43
  44   nativeBuildInputs = [
  45     pkg-config
  46     setuptools
  47   ];
  48
  49   nativeCheckInputs = [
  50     gdb
  51     numpy
  52     ncurses
  53   ];
  54
  55   LC_ALL = "en_US.UTF-8";
  56
  57   patches = [
  58     # backport Cython 3.0 trashcan support (https://github.com/cython/cython/pull/2842) to 0.X series.
  59     # it does not affect Python code unless the code explicitly uses the feature.
  60     # trashcan support is needed to avoid stack overflows during object deallocation in sage (https://trac.sagemath.org/ticket/27267)
  61     ./trashcan.patch
  62     # The above commit introduces custom trashcan macros, as well as
  63     # compiler changes to use them in Cython-emitted code. The latter
  64     # change is still useful, but the former has been upstreamed as of
  65     # Python 3.8, and the patch below makes Cython use the upstream
  66     # trashcan macros whenever available. This is needed for Python
  67     # 3.11 support, because the API used in Cython's implementation
  68     # changed: https://github.com/cython/cython/pull/4475
  69     (fetchpatch {
  70       name = "disable-trashcan.patch";
  71       url = "https://github.com/cython/cython/commit/e337825cdcf5e94d38ba06a0cb0188e99ce0cc92.patch";
  72       hash = "sha256-q0f63eetKrDpmP5Z4v8EuGxg26heSyp/62OYqhRoSso=";
  73     })
  74   ];
  75
  76   checkPhase = ''
  77     export HOME="$NIX_BUILD_TOP"
  78     ${python.interpreter} runtests.py -j$NIX_BUILD_CORES \
  79       --no-code-style \
  80       ${lib.optionalString (
  81         builtins.length excludedTests != 0
  82       ) ''--exclude="(${builtins.concatStringsSep "|" excludedTests})"''}
  83   '';
  84
  85   # https://github.com/cython/cython/issues/2785
  86   # Temporary solution
  87   doCheck = false;
  88   # doCheck = !stdenv.hostPlatform.isDarwin;
  89
  90   # force regeneration of generated code in source distributions
  91   # https://github.com/cython/cython/issues/5089
  92   setupHook = ./setup-hook.sh;
  93
  94   meta = {
  95     changelog = "https://github.com/cython/cython/blob/${version}/CHANGES.rst";
  96     description = "Optimising static compiler for both the Python programming language and the extended Cython programming language";
  97     homepage = "https://cython.org";
  98     license = lib.licenses.asl20;
  99   };
 100 }