pkgs/applications/graphics/imagej/default.nix

   1 { lib
   2 , stdenv
   3 , fetchurl
   4 , glib
   5 , jre
   6 , unzip
   7 , makeWrapper
   8 , makeDesktopItem
   9 , copyDesktopItems
  10 , wrapGAppsHook3
  11 }:
  12
  13 let
  14   icon = fetchurl {
  15     url = "https://imagej.net/media/icons/imagej.png";
  16     sha256 = "sha256-nU2nWI1wxZB/xlOKsZzdUjj+qiCTjO6GwEKYgZ5Risg=";
  17   };
  18 in stdenv.mkDerivation rec {
  19   pname = "imagej";
  20   version = "153";
  21
  22   src = fetchurl {
  23     url = "https://wsr.imagej.net/distros/cross-platform/ij${version}.zip";
  24     sha256 = "sha256-MGuUdUDuW3s/yGC68rHr6xxzmYScUjdXRawDpc1UQqw=";
  25   };
  26   nativeBuildInputs = [ copyDesktopItems makeWrapper unzip wrapGAppsHook3 ];
  27   buildInputs = [ glib ];
  28   dontWrapGApps = true;
  29
  30   desktopItems = lib.optionals stdenv.hostPlatform.isLinux [
  31     (makeDesktopItem {
  32       name = "ImageJ";
  33       desktopName = "ImageJ";
  34       icon = "imagej";
  35       categories = [ "Science" "Utility" "Graphics" ];
  36       exec = "imagej";
  37     })
  38   ];
  39
  40   passthru = {
  41     inherit jre;
  42   };
  43
  44   # JAR files that are intended to be used by other packages
  45   # should go to $out/share/java.
  46   # (Some uses ij.jar as a library not as a standalone program.)
  47   installPhase = ''
  48     runHook preInstall
  49
  50     mkdir -p $out/share/java $out/bin
  51     # Read permisssion suffices for the jar and others.
  52     # Simple cp shall clear suid bits, if any.
  53     cp ij.jar $out/share/java
  54     cp -dR luts macros plugins $out/share
  55
  56     runHook postInstall
  57   '';
  58
  59   postFixup = lib.optionalString stdenv.hostPlatform.isLinux ''
  60     makeWrapper ${jre}/bin/java $out/bin/imagej \
  61       ''${gappsWrapperArgs[@]} \
  62       --add-flags "-jar $out/share/java/ij.jar -ijpath $out/share"
  63
  64     install -Dm644 ${icon} $out/share/icons/hicolor/128x128/apps/imagej.png
  65     substituteInPlace $out/share/applications/ImageJ.desktop \
  66       --replace Exec=imagej Exec=$out/bin/imagej
  67   '';
  68
  69   meta = with lib; {
  70     homepage = "https://imagej.nih.gov/ij/";
  71     description = "Image processing and analysis in Java";
  72     longDescription = ''
  73       ImageJ is a public domain Java image processing program
  74       inspired by NIH Image for the Macintosh.
  75       It runs on any computer with a Java 1.4 or later virtual machine.
  76     '';
  77     sourceProvenance = with sourceTypes; [ binaryBytecode ];
  78     license = licenses.publicDomain;
  79     platforms = platforms.unix;
  80     maintainers = with maintainers; [ yuriaisaka ];
  81     mainProgram = "imagej";
  82   };
  83 }