pkgs/development/python-modules/pomegranate/default.nix

   1 { lib
   2 , buildPythonPackage
   3 , fetchFromGitHub
   4
   5 # build-system
   6 , setuptools
   7
   8 # dependencies
   9 , numpy
  10 , joblib
  11 , networkx
  12 , scipy
  13 , pyyaml
  14 , cython
  15 }:
  16
  17 buildPythonPackage rec {
  18   pname = "pomegranate";
  19   version = "0.14.8";
  20   pyproject = true;
  21
  22   src = fetchFromGitHub {
  23     repo = pname;
  24     owner = "jmschrei";
  25     # no tags for recent versions: https://github.com/jmschrei/pomegranate/issues/974
  26     rev = "refs/tags/v${version}";
  27     hash = "sha256-PoDAtNm/snq4isotkoCTVYUuwr9AKKwiXIojUFMH/YE=";
  28   };
  29
  30   nativeBuildInputs = [
  31     setuptools
  32   ];
  33
  34   propagatedBuildInputs = [
  35     numpy
  36     joblib
  37     networkx
  38     scipy
  39     pyyaml
  40     cython
  41   ];
  42
  43   # https://github.com/etal/cnvkit/issues/815
  44   passthru.skipBulkUpdate = true;
  45
  46   meta = with lib; {
  47     description = "Probabilistic and graphical models for Python, implemented in cython for speed";
  48     homepage = "https://github.com/jmschrei/pomegranate";
  49     license = licenses.mit;
  50     maintainers = with maintainers; [ rybern ];
  51   };
  52 }