Add gmx convert-trj
[gromacs.git] / src / gromacs / gpu_utils / cudautils.cu
blobbda125511b7a50f99f3df3bb30b77dee73359c6e
1 /*
2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
3  *
4  * Copyright (c) 2012,2014,2015,2016,2017,2018,2019, by the GROMACS development team, led by
5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
8  *
9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
12  * of the License, or (at your option) any later version.
13  *
14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
17  * Lesser General Public License for more details.
18  *
19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
20  * License along with GROMACS; if not, see
21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
23  *
24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
25  * consider that scientific software is very special. Version
26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
30  * official version at http://www.gromacs.org.
31  *
32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
34  */
36 #include "gmxpre.h"
38 #include "cudautils.cuh"
40 #include <cassert>
41 #include <cstdlib>
43 #include "gromacs/gpu_utils/cuda_arch_utils.cuh"
44 #include "gromacs/gpu_utils/gpu_utils.h"
45 #include "gromacs/utility/gmxassert.h"
47 /*** Generic CUDA data operation wrappers ***/
49 // TODO: template on transferKind to avoid runtime conditionals
50 int cu_copy_D2H(void *h_dest, void *d_src, size_t bytes,
51                 GpuApiCallBehavior transferKind, cudaStream_t s = nullptr)
53     cudaError_t stat;
55     if (h_dest == nullptr || d_src == nullptr || bytes == 0)
56     {
57         return -1;
58     }
60     switch (transferKind)
61     {
62         case GpuApiCallBehavior::Async:
63             GMX_ASSERT(isHostMemoryPinned(h_dest), "Destination buffer was not pinned for CUDA");
64             stat = cudaMemcpyAsync(h_dest, d_src, bytes, cudaMemcpyDeviceToHost, s);
65             CU_RET_ERR(stat, "DtoH cudaMemcpyAsync failed");
66             break;
68         case GpuApiCallBehavior::Sync:
69             stat = cudaMemcpy(h_dest, d_src, bytes, cudaMemcpyDeviceToHost);
70             CU_RET_ERR(stat, "DtoH cudaMemcpy failed");
71             break;
73         default:
74             throw;
75     }
77     return 0;
80 int cu_copy_D2H_sync(void * h_dest, void * d_src, size_t bytes)
82     return cu_copy_D2H(h_dest, d_src, bytes, GpuApiCallBehavior::Sync);
85 /*!
86  *  The copy is launched in stream s or if not specified, in stream 0.
87  */
88 int cu_copy_D2H_async(void * h_dest, void * d_src, size_t bytes, cudaStream_t s = nullptr)
90     return cu_copy_D2H(h_dest, d_src, bytes, GpuApiCallBehavior::Async, s);
93 // TODO: template on transferKind to avoid runtime conditionals
94 int cu_copy_H2D(void *d_dest, const void *h_src, size_t bytes,
95                 GpuApiCallBehavior transferKind, cudaStream_t s = nullptr)
97     cudaError_t stat;
99     if (d_dest == nullptr || h_src == nullptr || bytes == 0)
100     {
101         return -1;
102     }
104     switch (transferKind)
105     {
106         case GpuApiCallBehavior::Async:
107             GMX_ASSERT(isHostMemoryPinned(h_src), "Source buffer was not pinned for CUDA");
108             stat = cudaMemcpyAsync(d_dest, h_src, bytes, cudaMemcpyHostToDevice, s);
109             CU_RET_ERR(stat, "HtoD cudaMemcpyAsync failed");
110             break;
112         case GpuApiCallBehavior::Sync:
113             stat = cudaMemcpy(d_dest, h_src, bytes, cudaMemcpyHostToDevice);
114             CU_RET_ERR(stat, "HtoD cudaMemcpy failed");
115             break;
117         default:
118             throw;
119     }
121     return 0;
124 int cu_copy_H2D_sync(void * d_dest, const void * h_src, size_t bytes)
126     return cu_copy_H2D(d_dest, h_src, bytes, GpuApiCallBehavior::Sync);
130  *  The copy is launched in stream s or if not specified, in stream 0.
131  */
132 int cu_copy_H2D_async(void * d_dest, const void * h_src, size_t bytes, cudaStream_t s = nullptr)
134     return cu_copy_H2D(d_dest, h_src, bytes, GpuApiCallBehavior::Async, s);
137 /*! \brief Set up texture object for an array of type T.
139  * Set up texture object for an array of type T and bind it to the device memory
140  * \p d_ptr points to.
142  * \tparam[in] T        Raw data type
143  * \param[out] texObj   texture object to initialize
144  * \param[in]  d_ptr    pointer to device global memory to bind \p texObj to
145  * \param[in]  sizeInBytes  size of memory area to bind \p texObj to
146  */
147 template <typename T>
148 static void setup1DTexture(cudaTextureObject_t &texObj,
149                            void                *d_ptr,
150                            size_t               sizeInBytes)
152     assert(!c_disableCudaTextures);
154     cudaError_t      stat;
155     cudaResourceDesc rd;
156     cudaTextureDesc  td;
158     memset(&rd, 0, sizeof(rd));
159     rd.resType                = cudaResourceTypeLinear;
160     rd.res.linear.devPtr      = d_ptr;
161     rd.res.linear.desc        = cudaCreateChannelDesc<T>();
162     rd.res.linear.sizeInBytes = sizeInBytes;
164     memset(&td, 0, sizeof(td));
165     td.readMode                 = cudaReadModeElementType;
166     stat = cudaCreateTextureObject(&texObj, &rd, &td, nullptr);
167     CU_RET_ERR(stat, "cudaCreateTextureObject failed");
170 template <typename T>
171 void initParamLookupTable(T                        * &d_ptr,
172                           cudaTextureObject_t        &texObj,
173                           const T                    *h_ptr,
174                           int                         numElem)
176     const size_t sizeInBytes = numElem * sizeof(*d_ptr);
177     cudaError_t  stat        = cudaMalloc((void **)&d_ptr, sizeInBytes);
178     CU_RET_ERR(stat, "cudaMalloc failed in initParamLookupTable");
179     cu_copy_H2D_sync(d_ptr, (void *)h_ptr, sizeInBytes);
181     if (!c_disableCudaTextures)
182     {
183         setup1DTexture<T>(texObj, d_ptr, sizeInBytes);
184     }
187 template <typename T>
188 void destroyParamLookupTable(T                       *d_ptr,
189                              cudaTextureObject_t      texObj)
191     if (!c_disableCudaTextures)
192     {
193         CU_RET_ERR(cudaDestroyTextureObject(texObj), "cudaDestroyTextureObject on texObj failed");
194     }
195     CU_RET_ERR(cudaFree(d_ptr), "cudaFree failed");
198 /*! \brief Add explicit instantiations of init/destroyParamLookupTable() here as needed.
199  * One should also verify that the result of cudaCreateChannelDesc<T>() during texture setup
200  * looks reasonable, when instantiating the templates for new types - just in case.
201  */
202 template void initParamLookupTable<float>(float * &, cudaTextureObject_t &, const float *, int);
203 template void destroyParamLookupTable<float>(float *, cudaTextureObject_t);
204 template void initParamLookupTable<int>(int * &, cudaTextureObject_t &, const int *, int);
205 template void destroyParamLookupTable<int>(int *, cudaTextureObject_t);