Improved wallcycle reporting
[gromacs/AngularHB.git] / COPYING
blob23867a8ee62798e2d5fc87e57c1e38c18e48dab8
1 GROMACS is free software, distributed under the GNU Lesser General
2 Public License (LGPL) Version 2.1. See section 1 for details. GROMACS
3 includes optional code covered by several different licences as
4 described below.  The GROMACS package in its entirety may be copied,
5 modified or distributed according to the conditions described in
6 section 1.  However, in the interests of clarity and completeness,
7 some individual parts of GROMACS that can be used under their
8 respective licenses are also noted here.
10 This file contains the licenses for the following bodies of code:
11 1. GROMACS
12 2. Trajectory file reading using VMD plugins
13 3. Internal FFT (fftpack)
14 4. The memtestG80 library
15 5. thread_mpi
16 6. Blas
17 7. Lapack
18 8. Subset of Boost C++ library
19 9. Google Test and Google Mock
20 10. Sun XDR implementation (External Data Representation)
21 11. Sun FDLIBM (Freely Distributable Maths Library)
23 Our chosen method for packaging distributions (CPack) only permits a
24 package to have a single license file, so we are unfortunately forced
25 to combine all of this information into a single license file. Sorry
26 about that.
28 ============================================
30 1. GROMACS
31 ==========
33 As our use of the LGPL conveys upon a licensee the option to
34 redistribute the library under the terms of the plain GPL, we must
35 include a copy of that GPL for their reference. The applicable GPL
36 license comes after the applicable LGPL license in this file.
38 ============================================
40                   GNU LESSER GENERAL PUBLIC LICENSE
41                        Version 2.1, February 1999
43  Copyright (C) 1991, 1999 Free Software Foundation, Inc.
44  51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA
45  Everyone is permitted to copy and distribute verbatim copies
46  of this license document, but changing it is not allowed.
48 [This is the first released version of the Lesser GPL.  It also counts
49  as the successor of the GNU Library Public License, version 2, hence
50  the version number 2.1.]
52                             Preamble
54   The licenses for most software are designed to take away your
55 freedom to share and change it.  By contrast, the GNU General Public
56 Licenses are intended to guarantee your freedom to share and change
57 free software--to make sure the software is free for all its users.
59   This license, the Lesser General Public License, applies to some
60 specially designated software packages--typically libraries--of the
61 Free Software Foundation and other authors who decide to use it.  You
62 can use it too, but we suggest you first think carefully about whether
63 this license or the ordinary General Public License is the better
64 strategy to use in any particular case, based on the explanations below.
66   When we speak of free software, we are referring to freedom of use,
67 not price.  Our General Public Licenses are designed to make sure that
68 you have the freedom to distribute copies of free software (and charge
69 for this service if you wish); that you receive source code or can get
70 it if you want it; that you can change the software and use pieces of
71 it in new free programs; and that you are informed that you can do
72 these things.
74   To protect your rights, we need to make restrictions that forbid
75 distributors to deny you these rights or to ask you to surrender these
76 rights.  These restrictions translate to certain responsibilities for
77 you if you distribute copies of the library or if you modify it.
79   For example, if you distribute copies of the library, whether gratis
80 or for a fee, you must give the recipients all the rights that we gave
81 you.  You must make sure that they, too, receive or can get the source
82 code.  If you link other code with the library, you must provide
83 complete object files to the recipients, so that they can relink them
84 with the library after making changes to the library and recompiling
85 it.  And you must show them these terms so they know their rights.
87   We protect your rights with a two-step method: (1) we copyright the
88 library, and (2) we offer you this license, which gives you legal
89 permission to copy, distribute and/or modify the library.
91   To protect each distributor, we want to make it very clear that
92 there is no warranty for the free library.  Also, if the library is
93 modified by someone else and passed on, the recipients should know
94 that what they have is not the original version, so that the original
95 author's reputation will not be affected by problems that might be
96 introduced by others.
98   Finally, software patents pose a constant threat to the existence of
99 any free program.  We wish to make sure that a company cannot
100 effectively restrict the users of a free program by obtaining a
101 restrictive license from a patent holder.  Therefore, we insist that
102 any patent license obtained for a version of the library must be
103 consistent with the full freedom of use specified in this license.
105   Most GNU software, including some libraries, is covered by the
106 ordinary GNU General Public License.  This license, the GNU Lesser
107 General Public License, applies to certain designated libraries, and
108 is quite different from the ordinary General Public License.  We use
109 this license for certain libraries in order to permit linking those
110 libraries into non-free programs.
112   When a program is linked with a library, whether statically or using
113 a shared library, the combination of the two is legally speaking a
114 combined work, a derivative of the original library.  The ordinary
115 General Public License therefore permits such linking only if the
116 entire combination fits its criteria of freedom.  The Lesser General
117 Public License permits more lax criteria for linking other code with
118 the library.
120   We call this license the "Lesser" General Public License because it
121 does Less to protect the user's freedom than the ordinary General
122 Public License.  It also provides other free software developers Less
123 of an advantage over competing non-free programs.  These disadvantages
124 are the reason we use the ordinary General Public License for many
125 libraries.  However, the Lesser license provides advantages in certain
126 special circumstances.
128   For example, on rare occasions, there may be a special need to
129 encourage the widest possible use of a certain library, so that it becomes
130 a de-facto standard.  To achieve this, non-free programs must be
131 allowed to use the library.  A more frequent case is that a free
132 library does the same job as widely used non-free libraries.  In this
133 case, there is little to gain by limiting the free library to free
134 software only, so we use the Lesser General Public License.
136   In other cases, permission to use a particular library in non-free
137 programs enables a greater number of people to use a large body of
138 free software.  For example, permission to use the GNU C Library in
139 non-free programs enables many more people to use the whole GNU
140 operating system, as well as its variant, the GNU/Linux operating
141 system.
143   Although the Lesser General Public License is Less protective of the
144 users' freedom, it does ensure that the user of a program that is
145 linked with the Library has the freedom and the wherewithal to run
146 that program using a modified version of the Library.
148   The precise terms and conditions for copying, distribution and
149 modification follow.  Pay close attention to the difference between a
150 "work based on the library" and a "work that uses the library".  The
151 former contains code derived from the library, whereas the latter must
152 be combined with the library in order to run.
154                   GNU LESSER GENERAL PUBLIC LICENSE
155    TERMS AND CONDITIONS FOR COPYING, DISTRIBUTION AND MODIFICATION
157   0. This License Agreement applies to any software library or other
158 program which contains a notice placed by the copyright holder or
159 other authorized party saying it may be distributed under the terms of
160 this Lesser General Public License (also called "this License").
161 Each licensee is addressed as "you".
163   A "library" means a collection of software functions and/or data
164 prepared so as to be conveniently linked with application programs
165 (which use some of those functions and data) to form executables.
167   The "Library", below, refers to any such software library or work
168 which has been distributed under these terms.  A "work based on the
169 Library" means either the Library or any derivative work under
170 copyright law: that is to say, a work containing the Library or a
171 portion of it, either verbatim or with modifications and/or translated
172 straightforwardly into another language.  (Hereinafter, translation is
173 included without limitation in the term "modification".)
175   "Source code" for a work means the preferred form of the work for
176 making modifications to it.  For a library, complete source code means
177 all the source code for all modules it contains, plus any associated
178 interface definition files, plus the scripts used to control compilation
179 and installation of the library.
181   Activities other than copying, distribution and modification are not
182 covered by this License; they are outside its scope.  The act of
183 running a program using the Library is not restricted, and output from
184 such a program is covered only if its contents constitute a work based
185 on the Library (independent of the use of the Library in a tool for
186 writing it).  Whether that is true depends on what the Library does
187 and what the program that uses the Library does.
189   1. You may copy and distribute verbatim copies of the Library's
190 complete source code as you receive it, in any medium, provided that
191 you conspicuously and appropriately publish on each copy an
192 appropriate copyright notice and disclaimer of warranty; keep intact
193 all the notices that refer to this License and to the absence of any
194 warranty; and distribute a copy of this License along with the
195 Library.
197   You may charge a fee for the physical act of transferring a copy,
198 and you may at your option offer warranty protection in exchange for a
199 fee.
201   2. You may modify your copy or copies of the Library or any portion
202 of it, thus forming a work based on the Library, and copy and
203 distribute such modifications or work under the terms of Section 1
204 above, provided that you also meet all of these conditions:
206     a) The modified work must itself be a software library.
208     b) You must cause the files modified to carry prominent notices
209     stating that you changed the files and the date of any change.
211     c) You must cause the whole of the work to be licensed at no
212     charge to all third parties under the terms of this License.
214     d) If a facility in the modified Library refers to a function or a
215     table of data to be supplied by an application program that uses
216     the facility, other than as an argument passed when the facility
217     is invoked, then you must make a good faith effort to ensure that,
218     in the event an application does not supply such function or
219     table, the facility still operates, and performs whatever part of
220     its purpose remains meaningful.
222     (For example, a function in a library to compute square roots has
223     a purpose that is entirely well-defined independent of the
224     application.  Therefore, Subsection 2d requires that any
225     application-supplied function or table used by this function must
226     be optional: if the application does not supply it, the square
227     root function must still compute square roots.)
229 These requirements apply to the modified work as a whole.  If
230 identifiable sections of that work are not derived from the Library,
231 and can be reasonably considered independent and separate works in
232 themselves, then this License, and its terms, do not apply to those
233 sections when you distribute them as separate works.  But when you
234 distribute the same sections as part of a whole which is a work based
235 on the Library, the distribution of the whole must be on the terms of
236 this License, whose permissions for other licensees extend to the
237 entire whole, and thus to each and every part regardless of who wrote
240 Thus, it is not the intent of this section to claim rights or contest
241 your rights to work written entirely by you; rather, the intent is to
242 exercise the right to control the distribution of derivative or
243 collective works based on the Library.
245 In addition, mere aggregation of another work not based on the Library
246 with the Library (or with a work based on the Library) on a volume of
247 a storage or distribution medium does not bring the other work under
248 the scope of this License.
250   3. You may opt to apply the terms of the ordinary GNU General Public
251 License instead of this License to a given copy of the Library.  To do
252 this, you must alter all the notices that refer to this License, so
253 that they refer to the ordinary GNU General Public License, version 2,
254 instead of to this License.  (If a newer version than version 2 of the
255 ordinary GNU General Public License has appeared, then you can specify
256 that version instead if you wish.)  Do not make any other change in
257 these notices.
259   Once this change is made in a given copy, it is irreversible for
260 that copy, so the ordinary GNU General Public License applies to all
261 subsequent copies and derivative works made from that copy.
263   This option is useful when you wish to copy part of the code of
264 the Library into a program that is not a library.
266   4. You may copy and distribute the Library (or a portion or
267 derivative of it, under Section 2) in object code or executable form
268 under the terms of Sections 1 and 2 above provided that you accompany
269 it with the complete corresponding machine-readable source code, which
270 must be distributed under the terms of Sections 1 and 2 above on a
271 medium customarily used for software interchange.
273   If distribution of object code is made by offering access to copy
274 from a designated place, then offering equivalent access to copy the
275 source code from the same place satisfies the requirement to
276 distribute the source code, even though third parties are not
277 compelled to copy the source along with the object code.
279   5. A program that contains no derivative of any portion of the
280 Library, but is designed to work with the Library by being compiled or
281 linked with it, is called a "work that uses the Library".  Such a
282 work, in isolation, is not a derivative work of the Library, and
283 therefore falls outside the scope of this License.
285   However, linking a "work that uses the Library" with the Library
286 creates an executable that is a derivative of the Library (because it
287 contains portions of the Library), rather than a "work that uses the
288 library".  The executable is therefore covered by this License.
289 Section 6 states terms for distribution of such executables.
291   When a "work that uses the Library" uses material from a header file
292 that is part of the Library, the object code for the work may be a
293 derivative work of the Library even though the source code is not.
294 Whether this is true is especially significant if the work can be
295 linked without the Library, or if the work is itself a library.  The
296 threshold for this to be true is not precisely defined by law.
298   If such an object file uses only numerical parameters, data
299 structure layouts and accessors, and small macros and small inline
300 functions (ten lines or less in length), then the use of the object
301 file is unrestricted, regardless of whether it is legally a derivative
302 work.  (Executables containing this object code plus portions of the
303 Library will still fall under Section 6.)
305   Otherwise, if the work is a derivative of the Library, you may
306 distribute the object code for the work under the terms of Section 6.
307 Any executables containing that work also fall under Section 6,
308 whether or not they are linked directly with the Library itself.
310   6. As an exception to the Sections above, you may also combine or
311 link a "work that uses the Library" with the Library to produce a
312 work containing portions of the Library, and distribute that work
313 under terms of your choice, provided that the terms permit
314 modification of the work for the customer's own use and reverse
315 engineering for debugging such modifications.
317   You must give prominent notice with each copy of the work that the
318 Library is used in it and that the Library and its use are covered by
319 this License.  You must supply a copy of this License.  If the work
320 during execution displays copyright notices, you must include the
321 copyright notice for the Library among them, as well as a reference
322 directing the user to the copy of this License.  Also, you must do one
323 of these things:
325     a) Accompany the work with the complete corresponding
326     machine-readable source code for the Library including whatever
327     changes were used in the work (which must be distributed under
328     Sections 1 and 2 above); and, if the work is an executable linked
329     with the Library, with the complete machine-readable "work that
330     uses the Library", as object code and/or source code, so that the
331     user can modify the Library and then relink to produce a modified
332     executable containing the modified Library.  (It is understood
333     that the user who changes the contents of definitions files in the
334     Library will not necessarily be able to recompile the application
335     to use the modified definitions.)
337     b) Use a suitable shared library mechanism for linking with the
338     Library.  A suitable mechanism is one that (1) uses at run time a
339     copy of the library already present on the user's computer system,
340     rather than copying library functions into the executable, and (2)
341     will operate properly with a modified version of the library, if
342     the user installs one, as long as the modified version is
343     interface-compatible with the version that the work was made with.
345     c) Accompany the work with a written offer, valid for at
346     least three years, to give the same user the materials
347     specified in Subsection 6a, above, for a charge no more
348     than the cost of performing this distribution.
350     d) If distribution of the work is made by offering access to copy
351     from a designated place, offer equivalent access to copy the above
352     specified materials from the same place.
354     e) Verify that the user has already received a copy of these
355     materials or that you have already sent this user a copy.
357   For an executable, the required form of the "work that uses the
358 Library" must include any data and utility programs needed for
359 reproducing the executable from it.  However, as a special exception,
360 the materials to be distributed need not include anything that is
361 normally distributed (in either source or binary form) with the major
362 components (compiler, kernel, and so on) of the operating system on
363 which the executable runs, unless that component itself accompanies
364 the executable.
366   It may happen that this requirement contradicts the license
367 restrictions of other proprietary libraries that do not normally
368 accompany the operating system.  Such a contradiction means you cannot
369 use both them and the Library together in an executable that you
370 distribute.
372   7. You may place library facilities that are a work based on the
373 Library side-by-side in a single library together with other library
374 facilities not covered by this License, and distribute such a combined
375 library, provided that the separate distribution of the work based on
376 the Library and of the other library facilities is otherwise
377 permitted, and provided that you do these two things:
379     a) Accompany the combined library with a copy of the same work
380     based on the Library, uncombined with any other library
381     facilities.  This must be distributed under the terms of the
382     Sections above.
384     b) Give prominent notice with the combined library of the fact
385     that part of it is a work based on the Library, and explaining
386     where to find the accompanying uncombined form of the same work.
388   8. You may not copy, modify, sublicense, link with, or distribute
389 the Library except as expressly provided under this License.  Any
390 attempt otherwise to copy, modify, sublicense, link with, or
391 distribute the Library is void, and will automatically terminate your
392 rights under this License.  However, parties who have received copies,
393 or rights, from you under this License will not have their licenses
394 terminated so long as such parties remain in full compliance.
396   9. You are not required to accept this License, since you have not
397 signed it.  However, nothing else grants you permission to modify or
398 distribute the Library or its derivative works.  These actions are
399 prohibited by law if you do not accept this License.  Therefore, by
400 modifying or distributing the Library (or any work based on the
401 Library), you indicate your acceptance of this License to do so, and
402 all its terms and conditions for copying, distributing or modifying
403 the Library or works based on it.
405   10. Each time you redistribute the Library (or any work based on the
406 Library), the recipient automatically receives a license from the
407 original licensor to copy, distribute, link with or modify the Library
408 subject to these terms and conditions.  You may not impose any further
409 restrictions on the recipients' exercise of the rights granted herein.
410 You are not responsible for enforcing compliance by third parties with
411 this License.
413   11. If, as a consequence of a court judgment or allegation of patent
414 infringement or for any other reason (not limited to patent issues),
415 conditions are imposed on you (whether by court order, agreement or
416 otherwise) that contradict the conditions of this License, they do not
417 excuse you from the conditions of this License.  If you cannot
418 distribute so as to satisfy simultaneously your obligations under this
419 License and any other pertinent obligations, then as a consequence you
420 may not distribute the Library at all.  For example, if a patent
421 license would not permit royalty-free redistribution of the Library by
422 all those who receive copies directly or indirectly through you, then
423 the only way you could satisfy both it and this License would be to
424 refrain entirely from distribution of the Library.
426 If any portion of this section is held invalid or unenforceable under any
427 particular circumstance, the balance of the section is intended to apply,
428 and the section as a whole is intended to apply in other circumstances.
430 It is not the purpose of this section to induce you to infringe any
431 patents or other property right claims or to contest validity of any
432 such claims; this section has the sole purpose of protecting the
433 integrity of the free software distribution system which is
434 implemented by public license practices.  Many people have made
435 generous contributions to the wide range of software distributed
436 through that system in reliance on consistent application of that
437 system; it is up to the author/donor to decide if he or she is willing
438 to distribute software through any other system and a licensee cannot
439 impose that choice.
441 This section is intended to make thoroughly clear what is believed to
442 be a consequence of the rest of this License.
444   12. If the distribution and/or use of the Library is restricted in
445 certain countries either by patents or by copyrighted interfaces, the
446 original copyright holder who places the Library under this License may add
447 an explicit geographical distribution limitation excluding those countries,
448 so that distribution is permitted only in or among countries not thus
449 excluded.  In such case, this License incorporates the limitation as if
450 written in the body of this License.
452   13. The Free Software Foundation may publish revised and/or new
453 versions of the Lesser General Public License from time to time.
454 Such new versions will be similar in spirit to the present version,
455 but may differ in detail to address new problems or concerns.
457 Each version is given a distinguishing version number.  If the Library
458 specifies a version number of this License which applies to it and
459 "any later version", you have the option of following the terms and
460 conditions either of that version or of any later version published by
461 the Free Software Foundation.  If the Library does not specify a
462 license version number, you may choose any version ever published by
463 the Free Software Foundation.
465   14. If you wish to incorporate parts of the Library into other free
466 programs whose distribution conditions are incompatible with these,
467 write to the author to ask for permission.  For software which is
468 copyrighted by the Free Software Foundation, write to the Free
469 Software Foundation; we sometimes make exceptions for this.  Our
470 decision will be guided by the two goals of preserving the free status
471 of all derivatives of our free software and of promoting the sharing
472 and reuse of software generally.
474                             NO WARRANTY
476   15. BECAUSE THE LIBRARY IS LICENSED FREE OF CHARGE, THERE IS NO
477 WARRANTY FOR THE LIBRARY, TO THE EXTENT PERMITTED BY APPLICABLE LAW.
478 EXCEPT WHEN OTHERWISE STATED IN WRITING THE COPYRIGHT HOLDERS AND/OR
479 OTHER PARTIES PROVIDE THE LIBRARY "AS IS" WITHOUT WARRANTY OF ANY
480 KIND, EITHER EXPRESSED OR IMPLIED, INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, THE
481 IMPLIED WARRANTIES OF MERCHANTABILITY AND FITNESS FOR A PARTICULAR
482 PURPOSE.  THE ENTIRE RISK AS TO THE QUALITY AND PERFORMANCE OF THE
483 LIBRARY IS WITH YOU.  SHOULD THE LIBRARY PROVE DEFECTIVE, YOU ASSUME
484 THE COST OF ALL NECESSARY SERVICING, REPAIR OR CORRECTION.
486   16. IN NO EVENT UNLESS REQUIRED BY APPLICABLE LAW OR AGREED TO IN
487 WRITING WILL ANY COPYRIGHT HOLDER, OR ANY OTHER PARTY WHO MAY MODIFY
488 AND/OR REDISTRIBUTE THE LIBRARY AS PERMITTED ABOVE, BE LIABLE TO YOU
489 FOR DAMAGES, INCLUDING ANY GENERAL, SPECIAL, INCIDENTAL OR
490 CONSEQUENTIAL DAMAGES ARISING OUT OF THE USE OR INABILITY TO USE THE
491 LIBRARY (INCLUDING BUT NOT LIMITED TO LOSS OF DATA OR DATA BEING
492 RENDERED INACCURATE OR LOSSES SUSTAINED BY YOU OR THIRD PARTIES OR A
493 FAILURE OF THE LIBRARY TO OPERATE WITH ANY OTHER SOFTWARE), EVEN IF
494 SUCH HOLDER OR OTHER PARTY HAS BEEN ADVISED OF THE POSSIBILITY OF SUCH
495 DAMAGES.
497                      END OF TERMS AND CONDITIONS
499            How to Apply These Terms to Your New Libraries
501   If you develop a new library, and you want it to be of the greatest
502 possible use to the public, we recommend making it free software that
503 everyone can redistribute and change.  You can do so by permitting
504 redistribution under these terms (or, alternatively, under the terms of the
505 ordinary General Public License).
507   To apply these terms, attach the following notices to the library.  It is
508 safest to attach them to the start of each source file to most effectively
509 convey the exclusion of warranty; and each file should have at least the
510 "copyright" line and a pointer to where the full notice is found.
512     <one line to give the library's name and a brief idea of what it does.>
513     Copyright (C) <year>  <name of author>
515     This library is free software; you can redistribute it and/or
516     modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
517     License as published by the Free Software Foundation; either
518     version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
520     This library is distributed in the hope that it will be useful,
521     but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
522     MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
523     Lesser General Public License for more details.
525     You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
526     License along with this library; if not, write to the Free Software
527     Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA
529 Also add information on how to contact you by electronic and paper mail.
531 You should also get your employer (if you work as a programmer) or your
532 school, if any, to sign a "copyright disclaimer" for the library, if
533 necessary.  Here is a sample; alter the names:
535   Yoyodyne, Inc., hereby disclaims all copyright interest in the
536   library `Frob' (a library for tweaking knobs) written by James Random Hacker.
538   <signature of Ty Coon>, 1 April 1990
539   Ty Coon, President of Vice
541 That's all there is to it!
543 ============================================
545                     GNU GENERAL PUBLIC LICENSE
546                        Version 2, June 1991
548  Copyright (C) 1989, 1991 Free Software Foundation, Inc.,
549  51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301 USA
550  Everyone is permitted to copy and distribute verbatim copies
551  of this license document, but changing it is not allowed.
553                             Preamble
555   The licenses for most software are designed to take away your
556 freedom to share and change it.  By contrast, the GNU General Public
557 License is intended to guarantee your freedom to share and change free
558 software--to make sure the software is free for all its users.  This
559 General Public License applies to most of the Free Software
560 Foundation's software and to any other program whose authors commit to
561 using it.  (Some other Free Software Foundation software is covered by
562 the GNU Lesser General Public License instead.)  You can apply it to
563 your programs, too.
565   When we speak of free software, we are referring to freedom, not
566 price.  Our General Public Licenses are designed to make sure that you
567 have the freedom to distribute copies of free software (and charge for
568 this service if you wish), that you receive source code or can get it
569 if you want it, that you can change the software or use pieces of it
570 in new free programs; and that you know you can do these things.
572   To protect your rights, we need to make restrictions that forbid
573 anyone to deny you these rights or to ask you to surrender the rights.
574 These restrictions translate to certain responsibilities for you if you
575 distribute copies of the software, or if you modify it.
577   For example, if you distribute copies of such a program, whether
578 gratis or for a fee, you must give the recipients all the rights that
579 you have.  You must make sure that they, too, receive or can get the
580 source code.  And you must show them these terms so they know their
581 rights.
583   We protect your rights with two steps: (1) copyright the software, and
584 (2) offer you this license which gives you legal permission to copy,
585 distribute and/or modify the software.
587   Also, for each author's protection and ours, we want to make certain
588 that everyone understands that there is no warranty for this free
589 software.  If the software is modified by someone else and passed on, we
590 want its recipients to know that what they have is not the original, so
591 that any problems introduced by others will not reflect on the original
592 authors' reputations.
594   Finally, any free program is threatened constantly by software
595 patents.  We wish to avoid the danger that redistributors of a free
596 program will individually obtain patent licenses, in effect making the
597 program proprietary.  To prevent this, we have made it clear that any
598 patent must be licensed for everyone's free use or not licensed at all.
600   The precise terms and conditions for copying, distribution and
601 modification follow.
603                     GNU GENERAL PUBLIC LICENSE
604    TERMS AND CONDITIONS FOR COPYING, DISTRIBUTION AND MODIFICATION
606   0. This License applies to any program or other work which contains
607 a notice placed by the copyright holder saying it may be distributed
608 under the terms of this General Public License.  The "Program", below,
609 refers to any such program or work, and a "work based on the Program"
610 means either the Program or any derivative work under copyright law:
611 that is to say, a work containing the Program or a portion of it,
612 either verbatim or with modifications and/or translated into another
613 language.  (Hereinafter, translation is included without limitation in
614 the term "modification".)  Each licensee is addressed as "you".
616 Activities other than copying, distribution and modification are not
617 covered by this License; they are outside its scope.  The act of
618 running the Program is not restricted, and the output from the Program
619 is covered only if its contents constitute a work based on the
620 Program (independent of having been made by running the Program).
621 Whether that is true depends on what the Program does.
623   1. You may copy and distribute verbatim copies of the Program's
624 source code as you receive it, in any medium, provided that you
625 conspicuously and appropriately publish on each copy an appropriate
626 copyright notice and disclaimer of warranty; keep intact all the
627 notices that refer to this License and to the absence of any warranty;
628 and give any other recipients of the Program a copy of this License
629 along with the Program.
631 You may charge a fee for the physical act of transferring a copy, and
632 you may at your option offer warranty protection in exchange for a fee.
634   2. You may modify your copy or copies of the Program or any portion
635 of it, thus forming a work based on the Program, and copy and
636 distribute such modifications or work under the terms of Section 1
637 above, provided that you also meet all of these conditions:
639     a) You must cause the modified files to carry prominent notices
640     stating that you changed the files and the date of any change.
642     b) You must cause any work that you distribute or publish, that in
643     whole or in part contains or is derived from the Program or any
644     part thereof, to be licensed as a whole at no charge to all third
645     parties under the terms of this License.
647     c) If the modified program normally reads commands interactively
648     when run, you must cause it, when started running for such
649     interactive use in the most ordinary way, to print or display an
650     announcement including an appropriate copyright notice and a
651     notice that there is no warranty (or else, saying that you provide
652     a warranty) and that users may redistribute the program under
653     these conditions, and telling the user how to view a copy of this
654     License.  (Exception: if the Program itself is interactive but
655     does not normally print such an announcement, your work based on
656     the Program is not required to print an announcement.)
658 These requirements apply to the modified work as a whole.  If
659 identifiable sections of that work are not derived from the Program,
660 and can be reasonably considered independent and separate works in
661 themselves, then this License, and its terms, do not apply to those
662 sections when you distribute them as separate works.  But when you
663 distribute the same sections as part of a whole which is a work based
664 on the Program, the distribution of the whole must be on the terms of
665 this License, whose permissions for other licensees extend to the
666 entire whole, and thus to each and every part regardless of who wrote it.
668 Thus, it is not the intent of this section to claim rights or contest
669 your rights to work written entirely by you; rather, the intent is to
670 exercise the right to control the distribution of derivative or
671 collective works based on the Program.
673 In addition, mere aggregation of another work not based on the Program
674 with the Program (or with a work based on the Program) on a volume of
675 a storage or distribution medium does not bring the other work under
676 the scope of this License.
678   3. You may copy and distribute the Program (or a work based on it,
679 under Section 2) in object code or executable form under the terms of
680 Sections 1 and 2 above provided that you also do one of the following:
682     a) Accompany it with the complete corresponding machine-readable
683     source code, which must be distributed under the terms of Sections
684     1 and 2 above on a medium customarily used for software interchange; or,
686     b) Accompany it with a written offer, valid for at least three
687     years, to give any third party, for a charge no more than your
688     cost of physically performing source distribution, a complete
689     machine-readable copy of the corresponding source code, to be
690     distributed under the terms of Sections 1 and 2 above on a medium
691     customarily used for software interchange; or,
693     c) Accompany it with the information you received as to the offer
694     to distribute corresponding source code.  (This alternative is
695     allowed only for noncommercial distribution and only if you
696     received the program in object code or executable form with such
697     an offer, in accord with Subsection b above.)
699 The source code for a work means the preferred form of the work for
700 making modifications to it.  For an executable work, complete source
701 code means all the source code for all modules it contains, plus any
702 associated interface definition files, plus the scripts used to
703 control compilation and installation of the executable.  However, as a
704 special exception, the source code distributed need not include
705 anything that is normally distributed (in either source or binary
706 form) with the major components (compiler, kernel, and so on) of the
707 operating system on which the executable runs, unless that component
708 itself accompanies the executable.
710 If distribution of executable or object code is made by offering
711 access to copy from a designated place, then offering equivalent
712 access to copy the source code from the same place counts as
713 distribution of the source code, even though third parties are not
714 compelled to copy the source along with the object code.
716   4. You may not copy, modify, sublicense, or distribute the Program
717 except as expressly provided under this License.  Any attempt
718 otherwise to copy, modify, sublicense or distribute the Program is
719 void, and will automatically terminate your rights under this License.
720 However, parties who have received copies, or rights, from you under
721 this License will not have their licenses terminated so long as such
722 parties remain in full compliance.
724   5. You are not required to accept this License, since you have not
725 signed it.  However, nothing else grants you permission to modify or
726 distribute the Program or its derivative works.  These actions are
727 prohibited by law if you do not accept this License.  Therefore, by
728 modifying or distributing the Program (or any work based on the
729 Program), you indicate your acceptance of this License to do so, and
730 all its terms and conditions for copying, distributing or modifying
731 the Program or works based on it.
733   6. Each time you redistribute the Program (or any work based on the
734 Program), the recipient automatically receives a license from the
735 original licensor to copy, distribute or modify the Program subject to
736 these terms and conditions.  You may not impose any further
737 restrictions on the recipients' exercise of the rights granted herein.
738 You are not responsible for enforcing compliance by third parties to
739 this License.
741   7. If, as a consequence of a court judgment or allegation of patent
742 infringement or for any other reason (not limited to patent issues),
743 conditions are imposed on you (whether by court order, agreement or
744 otherwise) that contradict the conditions of this License, they do not
745 excuse you from the conditions of this License.  If you cannot
746 distribute so as to satisfy simultaneously your obligations under this
747 License and any other pertinent obligations, then as a consequence you
748 may not distribute the Program at all.  For example, if a patent
749 license would not permit royalty-free redistribution of the Program by
750 all those who receive copies directly or indirectly through you, then
751 the only way you could satisfy both it and this License would be to
752 refrain entirely from distribution of the Program.
754 If any portion of this section is held invalid or unenforceable under
755 any particular circumstance, the balance of the section is intended to
756 apply and the section as a whole is intended to apply in other
757 circumstances.
759 It is not the purpose of this section to induce you to infringe any
760 patents or other property right claims or to contest validity of any
761 such claims; this section has the sole purpose of protecting the
762 integrity of the free software distribution system, which is
763 implemented by public license practices.  Many people have made
764 generous contributions to the wide range of software distributed
765 through that system in reliance on consistent application of that
766 system; it is up to the author/donor to decide if he or she is willing
767 to distribute software through any other system and a licensee cannot
768 impose that choice.
770 This section is intended to make thoroughly clear what is believed to
771 be a consequence of the rest of this License.
773   8. If the distribution and/or use of the Program is restricted in
774 certain countries either by patents or by copyrighted interfaces, the
775 original copyright holder who places the Program under this License
776 may add an explicit geographical distribution limitation excluding
777 those countries, so that distribution is permitted only in or among
778 countries not thus excluded.  In such case, this License incorporates
779 the limitation as if written in the body of this License.
781   9. The Free Software Foundation may publish revised and/or new versions
782 of the General Public License from time to time.  Such new versions will
783 be similar in spirit to the present version, but may differ in detail to
784 address new problems or concerns.
786 Each version is given a distinguishing version number.  If the Program
787 specifies a version number of this License which applies to it and "any
788 later version", you have the option of following the terms and conditions
789 either of that version or of any later version published by the Free
790 Software Foundation.  If the Program does not specify a version number of
791 this License, you may choose any version ever published by the Free Software
792 Foundation.
794   10. If you wish to incorporate parts of the Program into other free
795 programs whose distribution conditions are different, write to the author
796 to ask for permission.  For software which is copyrighted by the Free
797 Software Foundation, write to the Free Software Foundation; we sometimes
798 make exceptions for this.  Our decision will be guided by the two goals
799 of preserving the free status of all derivatives of our free software and
800 of promoting the sharing and reuse of software generally.
802                             NO WARRANTY
804   11. BECAUSE THE PROGRAM IS LICENSED FREE OF CHARGE, THERE IS NO WARRANTY
805 FOR THE PROGRAM, TO THE EXTENT PERMITTED BY APPLICABLE LAW.  EXCEPT WHEN
806 OTHERWISE STATED IN WRITING THE COPYRIGHT HOLDERS AND/OR OTHER PARTIES
807 PROVIDE THE PROGRAM "AS IS" WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EITHER EXPRESSED
808 OR IMPLIED, INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, THE IMPLIED WARRANTIES OF
809 MERCHANTABILITY AND FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  THE ENTIRE RISK AS
810 TO THE QUALITY AND PERFORMANCE OF THE PROGRAM IS WITH YOU.  SHOULD THE
811 PROGRAM PROVE DEFECTIVE, YOU ASSUME THE COST OF ALL NECESSARY SERVICING,
812 REPAIR OR CORRECTION.
814   12. IN NO EVENT UNLESS REQUIRED BY APPLICABLE LAW OR AGREED TO IN WRITING
815 WILL ANY COPYRIGHT HOLDER, OR ANY OTHER PARTY WHO MAY MODIFY AND/OR
816 REDISTRIBUTE THE PROGRAM AS PERMITTED ABOVE, BE LIABLE TO YOU FOR DAMAGES,
817 INCLUDING ANY GENERAL, SPECIAL, INCIDENTAL OR CONSEQUENTIAL DAMAGES ARISING
818 OUT OF THE USE OR INABILITY TO USE THE PROGRAM (INCLUDING BUT NOT LIMITED
819 TO LOSS OF DATA OR DATA BEING RENDERED INACCURATE OR LOSSES SUSTAINED BY
820 YOU OR THIRD PARTIES OR A FAILURE OF THE PROGRAM TO OPERATE WITH ANY OTHER
821 PROGRAMS), EVEN IF SUCH HOLDER OR OTHER PARTY HAS BEEN ADVISED OF THE
822 POSSIBILITY OF SUCH DAMAGES.
824                      END OF TERMS AND CONDITIONS
826             How to Apply These Terms to Your New Programs
828   If you develop a new program, and you want it to be of the greatest
829 possible use to the public, the best way to achieve this is to make it
830 free software which everyone can redistribute and change under these terms.
832   To do so, attach the following notices to the program.  It is safest
833 to attach them to the start of each source file to most effectively
834 convey the exclusion of warranty; and each file should have at least
835 the "copyright" line and a pointer to where the full notice is found.
837     <one line to give the program's name and a brief idea of what it does.>
838     Copyright (C) <year>  <name of author>
840     This program is free software; you can redistribute it and/or modify
841     it under the terms of the GNU General Public License as published by
842     the Free Software Foundation; either version 2 of the License, or
843     (at your option) any later version.
845     This program is distributed in the hope that it will be useful,
846     but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
847     MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
848     GNU General Public License for more details.
850     You should have received a copy of the GNU General Public License along
851     with this program; if not, write to the Free Software Foundation, Inc.,
852     51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301 USA.
854 Also add information on how to contact you by electronic and paper mail.
856 If the program is interactive, make it output a short notice like this
857 when it starts in an interactive mode:
859     Gnomovision version 69, Copyright (C) year name of author
860     Gnomovision comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY; for details type `show w'.
861     This is free software, and you are welcome to redistribute it
862     under certain conditions; type `show c' for details.
864 The hypothetical commands `show w' and `show c' should show the appropriate
865 parts of the General Public License.  Of course, the commands you use may
866 be called something other than `show w' and `show c'; they could even be
867 mouse-clicks or menu items--whatever suits your program.
869 You should also get your employer (if you work as a programmer) or your
870 school, if any, to sign a "copyright disclaimer" for the program, if
871 necessary.  Here is a sample; alter the names:
873   Yoyodyne, Inc., hereby disclaims all copyright interest in the program
874   `Gnomovision' (which makes passes at compilers) written by James Hacker.
876   <signature of Ty Coon>, 1 April 1989
877   Ty Coon, President of Vice
879 This General Public License does not permit incorporating your program into
880 proprietary programs.  If your program is a subroutine library, you may
881 consider it more useful to permit linking proprietary applications with the
882 library.  If this is what you want to do, use the GNU Lesser General
883 Public License instead of this License.
885 2. Trajectory file reading using VMD plugins
886 ============================================
888    Files: src/external/vmd_molfile/
889           src/gromacs/fileio/vmdio.c
891                 (C) Copyright 1995-2009 The Board of Trustees of the
892                             University of Illinois
893                              All Rights Reserved
895 Developed by:           Theoretical and Computational Biophysics Group
896                         University of Illinois at Urbana-Champaign
897                         http://www.ks.uiuc.edu/
899 Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy of
900 this software and associated documentation files (the Software), to deal with
901 the Software without restriction, including without limitation the rights to
902 use, copy, modify, merge, publish, distribute, sublicense, and/or sell copies
903 of the Software, and to permit persons to whom the Software is furnished to
904 do so, subject to the following conditions:
906 Redistributions of source code must retain the above copyright notice,
907 this list of conditions and the following disclaimers.
909 Redistributions in binary form must reproduce the above copyright notice,
910 this list of conditions and the following disclaimers in the documentation
911 and/or other materials provided with the distribution.
913 Neither the names of Theoretical and Computational Biophysics Group,
914 University of Illinois at Urbana-Champaign, nor the names of its contributors
915 may be used to endorse or promote products derived from this Software without
916 specific prior written permission.
918 THE SOFTWARE IS PROVIDED AS IS, WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR
919 IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY,
920 FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENT.  IN NO EVENT SHALL
921 THE CONTRIBUTORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM, DAMAGES OR
922 OTHER LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE,
923 ARISING FROM, OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR
924 OTHER DEALINGS WITH THE SOFTWARE.
926 3. Internal FFT (ffpack)
927 ========================
929    Files: src/external/fftpack/fftpack.c
931 Copyright (c) 2005-2011, NumPy Developers.
932 All rights reserved.
934 Redistribution and use in source and binary forms, with or without
935 modification, are permitted provided that the following conditions are
936 met:
938     * Redistributions of source code must retain the above copyright
939        notice, this list of conditions and the following disclaimer.
941     * Redistributions in binary form must reproduce the above
942        copyright notice, this list of conditions and the following
943        disclaimer in the documentation and/or other materials provided
944        with the distribution.
946     * Neither the name of the NumPy Developers nor the names of any
947        contributors may be used to endorse or promote products derived
948        from this software without specific prior written permission.
950 THIS SOFTWARE IS PROVIDED BY THE COPYRIGHT HOLDERS AND CONTRIBUTORS
951 "AS IS" AND ANY EXPRESS OR IMPLIED WARRANTIES, INCLUDING, BUT NOT
952 LIMITED TO, THE IMPLIED WARRANTIES OF MERCHANTABILITY AND FITNESS FOR
953 A PARTICULAR PURPOSE ARE DISCLAIMED. IN NO EVENT SHALL THE COPYRIGHT
954 OWNER OR CONTRIBUTORS BE LIABLE FOR ANY DIRECT, INDIRECT, INCIDENTAL,
955 SPECIAL, EXEMPLARY, OR CONSEQUENTIAL DAMAGES (INCLUDING, BUT NOT
956 LIMITED TO, PROCUREMENT OF SUBSTITUTE GOODS OR SERVICES; LOSS OF USE,
957 DATA, OR PROFITS; OR BUSINESS INTERRUPTION) HOWEVER CAUSED AND ON ANY
958 THEORY OF LIABILITY, WHETHER IN CONTRACT, STRICT LIABILITY, OR TORT
959 (INCLUDING NEGLIGENCE OR OTHERWISE) ARISING IN ANY WAY OUT OF THE USE
960 OF THIS SOFTWARE, EVEN IF ADVISED OF THE POSSIBILITY OF SUCH DAMAGE.
962 fftpack.c : A set of FFT routines in C.
963 Algorithmically based on Fortran-77 FFTPACK by Paul N. Swarztrauber (Version 4, 1985).
965 4. The memtestG80 library
966 =========================
968    Files: src/gromacs/gmxlib/gpu_utils/memtestG80_core.*
970 The memtestG80 library, written by Imran Haque, is Copyright 2009 Stanford University,
971 covered by the LGPL license. It may be used under the following terms:
973 IN NO EVENT SHALL STANFORD UNIVERSITY BE LIABLE TO ANY PARTY FOR DIRECT, INDIRECT, 
974 SPECIAL, INCIDENTAL, OR CONSEQUENTIAL DAMAGES, INCLUDING LOST PROFITS, ARISING OUT OF
975 THE USE OF THIS SOFTWARE AND ITS DOCUMENTATION, EVEN IF STANFORD UNIVERSITY HAS BEEN 
976 ADVISED OF THE POSSIBILITY OF SUCH DAMAGE.
978 STANFORD UNIVERSITY SPECIFICALLY DISCLAIMS ANY WARRANTIES, INCLUDING, BUT NOT LIMITED 
979 TO, THE IMPLIED WARRANTIES OF MERCHANTABILITY AND FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. 
980 THE SOFTWARE AND ACCOMPANYING DOCUMENTATION PROVIDED HEREUNDER IS PROVIDED "AS IS". 
981 Folding@home HAS NO OBLIGATION TO PROVIDE MAINTENANCE, SUPPORT, UPDATES, ENHANCEMENTS, 
982 OR MODIFICATIONS.
984 Restrictions:
986 You may use this software on a computer system only if you own the system or have the 
987 written permission of the owner.
989 You may not alter the software or associated data files. 
991 Certain builds of this software incorporate by linkage code from the libintl
992 and libiconv libraries, which are covered by the Library GNU Public License,
993 available at http://www.gnu.org/licenses/lgpl-3.0.txt.
995 5. thread_mpi
996 =============
998    Files: src/gromacs/legacyheaders/thread_mpi/
999           src/gromacs/gmxlib/thread_mpi/
1001 Copyright (c) 2009-2012, Sander Pronk & Erik Lindahl.
1002 All rights reserved.
1004 Redistribution and use in source and binary forms, with or without
1005 modification, are permitted provided that the following conditions are met:
1006 1) Redistributions of source code must retain the above copyright
1007    notice, this list of conditions and the following disclaimer.
1008 2) Redistributions in binary form must reproduce the above copyright
1009    notice, this list of conditions and the following disclaimer in the
1010    documentation and/or other materials provided with the distribution.
1011 3) Neither the name of the <organization> nor the
1012    names of its contributors may be used to endorse or promote products
1013    derived from this software without specific prior written permission.
1015 THIS SOFTWARE IS PROVIDED BY US ''AS IS'' AND ANY
1016 EXPRESS OR IMPLIED WARRANTIES, INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, THE IMPLIED
1017 WARRANTIES OF MERCHANTABILITY AND FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE ARE
1018 DISCLAIMED. IN NO EVENT SHALL <copyright holder> BE LIABLE FOR ANY
1019 DIRECT, INDIRECT, INCIDENTAL, SPECIAL, EXEMPLARY, OR CONSEQUENTIAL DAMAGES
1020 (INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, PROCUREMENT OF SUBSTITUTE GOODS OR SERVICES;
1021 LOSS OF USE, DATA, OR PROFITS; OR BUSINESS INTERRUPTION) HOWEVER CAUSED AND
1022 ON ANY THEORY OF LIABILITY, WHETHER IN CONTRACT, STRICT LIABILITY, OR TORT
1023 (INCLUDING NEGLIGENCE OR OTHERWISE) ARISING IN ANY WAY OUT OF THE USE OF THIS
1024 SOFTWARE, EVEN IF ADVISED OF THE POSSIBILITY OF SUCH DAMAGE.
1026 If you want to redistribute modifications, please consider that
1027 scientific software is very special. Version control is crucial -
1028 bugs must be traceable. We will be happy to consider code for
1029 inclusion in the official distribution, but derived work should not
1030 be called official thread_mpi.
1032 6. Blas
1033 =======
1035 These files are semi-automatic translations by f2c from the original netlib BLAS library.
1036 The source has been modified to (mostly) use modern C formatting, and to get rid of
1037 compiler warnings. Any errors in doing this should be blamed on the Gromacs developers, and
1038 not the reference BLAS implementation.
1040 The reference BLAS implementation is available from http://www.netlib.org/blas
1042 BLAS does not come with a formal named "license", but a general statement that
1044 "The reference BLAS is a freely-available software package. It is available from netlib
1045 via anonymous ftp and the World Wide Web. Thus, it can be included in commercial software
1046 packages (and has been). We only ask that proper credit be given to the authors."
1048 While the rest of Gromacs is LGPL, we think it's only fair to give you the same rights to
1049 our modified BLAS files as the original netlib versions, so do what you want with them.
1050 However, be warned that we have only tested that they to the right thing in the cases used
1051 in Gromacs (primarily full & sparse matrix diagonalization), so in most cases it is a much
1052 better idea to use the full reference implementation.
1054 Erik Lindahl, 2008-10-07.
1056 7. Lapack
1057 =========
1059 These files are semi-automatic translations by f2c from the original netlib LAPACK library.
1060 The source has been modified to (mostly) use modern C formatting, and to get rid of
1061 compiler warnings. Any errors in doing this should be blamed on the Gromacs developers, and
1062 not the reference LAPACK implementation.
1064 The reference LAPACK implementation is available from http://www.netlib.org/lapack
1066 LAPACK does not come with a formal named "license", but a general statement saying:
1068 "The reference LAPACK is a freely-available software package. It is available from netlib
1069 via anonymous ftp and the World Wide Web. Thus, it can be included in commercial software
1070 packages (and has been). We only ask that proper credit be given to the authors."
1072 While the rest of Gromacs is LGPL, we think it's only fair to give you the same rights to
1073 our modified LAPACK files as the original netlib versions, so do what you want with them.
1075 However, be warned that we have only tested that they to the right thing in the cases used
1076 in Gromacs (primarily full & sparse matrix diagonalization), so in most cases it is a much
1077 better idea to use the full reference implementation.
1079 Erik Lindahl, 2008-10-07.
1081 8. Subset of Boost C++ library
1082 ==============================
1084    Files: src/external/boost/boost/*
1086 Boost Software License - Version 1.0 - August 17th, 2003
1088 Permission is hereby granted, free of charge, to any person or organization
1089 obtaining a copy of the software and accompanying documentation covered by
1090 this license (the "Software") to use, reproduce, display, distribute,
1091 execute, and transmit the Software, and to prepare derivative works of the
1092 Software, and to permit third-parties to whom the Software is furnished to
1093 do so, all subject to the following:
1095 The copyright notices in the Software and this entire statement, including
1096 the above license grant, this restriction and the following disclaimer,
1097 must be included in all copies of the Software, in whole or in part, and
1098 all derivative works of the Software, unless such copies or derivative
1099 works are solely in the form of machine-executable object code generated by
1100 a source language processor.
1102 THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR
1103 IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY,
1104 FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE, TITLE AND NON-INFRINGEMENT. IN NO EVENT
1105 SHALL THE COPYRIGHT HOLDERS OR ANYONE DISTRIBUTING THE SOFTWARE BE LIABLE
1106 FOR ANY DAMAGES OR OTHER LIABILITY, WHETHER IN CONTRACT, TORT OR OTHERWISE,
1107 ARISING FROM, OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER
1108 DEALINGS IN THE SOFTWARE.
1110 9. Google Test and Google Mock
1111 ===============================
1113    Files: src/external/gmock-1.7.0/*
1115 Copyright 2008, Google Inc.
1116 All rights reserved.
1118 Redistribution and use in source and binary forms, with or without
1119 modification, are permitted provided that the following conditions are
1120 met:
1122     * Redistributions of source code must retain the above copyright
1123 notice, this list of conditions and the following disclaimer.
1124     * Redistributions in binary form must reproduce the above
1125 copyright notice, this list of conditions and the following disclaimer
1126 in the documentation and/or other materials provided with the
1127 distribution.
1128     * Neither the name of Google Inc. nor the names of its
1129 contributors may be used to endorse or promote products derived from
1130 this software without specific prior written permission.
1132 THIS SOFTWARE IS PROVIDED BY THE COPYRIGHT HOLDERS AND CONTRIBUTORS
1133 "AS IS" AND ANY EXPRESS OR IMPLIED WARRANTIES, INCLUDING, BUT NOT
1134 LIMITED TO, THE IMPLIED WARRANTIES OF MERCHANTABILITY AND FITNESS FOR
1135 A PARTICULAR PURPOSE ARE DISCLAIMED. IN NO EVENT SHALL THE COPYRIGHT
1136 OWNER OR CONTRIBUTORS BE LIABLE FOR ANY DIRECT, INDIRECT, INCIDENTAL,
1137 SPECIAL, EXEMPLARY, OR CONSEQUENTIAL DAMAGES (INCLUDING, BUT NOT
1138 LIMITED TO, PROCUREMENT OF SUBSTITUTE GOODS OR SERVICES; LOSS OF USE,
1139 DATA, OR PROFITS; OR BUSINESS INTERRUPTION) HOWEVER CAUSED AND ON ANY
1140 THEORY OF LIABILITY, WHETHER IN CONTRACT, STRICT LIABILITY, OR TORT
1141 (INCLUDING NEGLIGENCE OR OTHERWISE) ARISING IN ANY WAY OUT OF THE USE
1142 OF THIS SOFTWARE, EVEN IF ADVISED OF THE POSSIBILITY OF SUCH DAMAGE.
1145 10. Sun Extensible Data Representation routines (XDR)
1146 =====================================================
1148     Files: src/gromacs/fileio/gmx_system_xdr.c
1150 Sun RPC is a product of Sun Microsystems, Inc. and is provided for
1151 unrestricted use provided that this legend is included on all tape
1152 media and as a part of the software program in whole or part.  Users
1153 may copy or modify Sun RPC without charge, but are not authorized
1154 to license or distribute it to anyone else except as part of a product or
1155 program developed by the user.
1157 SUN RPC IS PROVIDED AS IS WITH NO WARRANTIES OF ANY KIND INCLUDING THE
1158 WARRANTIES OF DESIGN, MERCHANTIBILITY AND FITNESS FOR A PARTICULAR
1159 PURPOSE, OR ARISING FROM A COURSE OF DEALING, USAGE OR TRADE PRACTICE.
1161 Sun RPC is provided with no support and without any obligation on the
1162 part of Sun Microsystems, Inc. to assist in its use, correction,
1163 modification or enhancement.
1165 SUN MICROSYSTEMS, INC. SHALL HAVE NO LIABILITY WITH RESPECT TO THE
1166 INFRINGEMENT OF COPYRIGHTS, TRADE SECRETS OR ANY PATENTS BY SUN RPC
1167 OR ANY PART THEREOF.
1169 In no event will Sun Microsystems, Inc. be liable for any lost revenue
1170 or profits or other special, indirect and consequential damages, even if
1171 Sun has been advised of the possibility of such damages.
1173 Sun Microsystems, Inc.
1174 2550 Garcia Avenue
1175 Mountain View, California  94043
1178 11. Sun FDLIBM (Freely Distributable Maths Library)
1179 ===================================================
1181     Files: src/gromacs/math/utilities.c
1183 Copyright (C) 1993 by Sun Microsystems, Inc. All rights reserved.
1185 Developed at SunSoft, a Sun Microsystems, Inc. business.
1186 Permission to use, copy, modify, and distribute this
1187 software is freely granted, provided that this notice
1188 is preserved.