Fixed bug 678 which was due to calling gmx_fatal without calling
[gromacs/AngularHB.git] / INSTALL.cmake
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1                     Welcome to GROMACS!
3 *Note*: Detailed, step-by-step installation instructions
4 are available on the website
5 http://www.gromacs.org/Downloads/Installation_Instructions.
7 *Note*: If you want to use automake for building look at INSTALL.
8         However, automake will be deprecated in releases after 4.5
12 Cmake  (cross-platform make) is a relatively new build system that
13 is gaining in popularity. One of the biggest selling points is
14 compatibility with MS Windows. Starting with the 4.5 release,
15 it is possible to configure and compile the source code with it.
17 GETTING CMAKE
19 Packages for various platforms can be found on the project's download page.
20 Most of the Linux distributions come with packages available through the
21 corresponding package manage. Make sure the installed version is 2.6 or later.
22 Using CMake
24 Please read carefully the documentation on the CMake website. Developers
25 may look at some of the online tutorials.
27 CONFIGURING WITH DEFAULTS SETTINGS
29 It is advisable that the configuration and the build of the binaries are done
30 outside of the source tree. On Linux/Mac, the following will configure
31 the build with the default settings:
33 $ tar xvfz gromacs-4.5.tar.gz
34 $ ls
35 gromacs-4.5
36 $ mkdir build
37 $ cd build
38 $ cmake ../gromacs-4.5
39 $ make
41 On multi-core CPU systems (very likely nowadays), the parallel make will do the job much faster:
43 $ make -j 4
44 $ make install
46 Substitute 4 with the number of available cores.
48 CONFIGURING WITH CUSTOM OPTIONS
50 Custom options can be set in a few different ways.A list of the more commonly
51 used ones can be found at http://www.gromacs.org/Developer_Zone/Cmake/Custom_options.
53  *command line flag
55 The values of custom options are supplied with the -D flag. Note that the source path should
56 be the last argument (otherwise remove the space between -D and the option)!
58 $ cmake -D GMX_DOUBLE=ON ../gromacs-4.5
60  *interactive CMake session
62 $ cmake -i ../gromacs-4.5
64  *curses cmake interface (ccmake)
66 $ ccmake ../gromacs-4.5
68  *CMake GUI
70 $ cmake-gui ../gromacs-4.5
72 Explanation about the different options will be presented when using any of the
73 interactive, curses or gui methods.
75 All configure options are saved in the CMakeCache.txt file in the build directory.
76 The file can be edited using a text editor, but after that cmake should be run again.
78 $ vim CMakeCache.txt
79 $ cmake ../gromacs-4.5