man/man1/g_wheel.1

   1 .TH g_wheel 1 "Mon 4 Apr 2011" "" "GROMACS suite, VERSION 4.5.4-dev-20110404-bc5695c"
   2 .SH NAME
   3 g_wheel - plots helical wheels
   4
   5 .B VERSION 4.5.4-dev-20110404-bc5695c
   6 .SH SYNOPSIS
   7 \f3g_wheel\fP
   8 .BI "\-f" " nnnice.dat "
   9 .BI "\-o" " plot.eps "
  10 .BI "\-[no]h" ""
  11 .BI "\-[no]version" ""
  12 .BI "\-nice" " int "
  13 .BI "\-r0" " int "
  14 .BI "\-rot0" " real "
  15 .BI "\-T" " string "
  16 .BI "\-[no]nn" ""
  17 .SH DESCRIPTION
  18 \&\fB g_wheel\fR plots a helical wheel representation of your sequence.
  19 \&The input sequence is in the \fB .dat\fR file where the first line contains
  20 \&the number of residues and each consecutive line contains a residue name.
  21 .SH FILES
  22 .BI "\-f" " nnnice.dat"
  23 .B Input
  24  Generic data file
  25
  26 .BI "\-o" " plot.eps"
  27 .B Output
  28  Encapsulated PostScript (tm) file
  29
  30 .SH OTHER OPTIONS
  31 .BI "\-[no]h"  "no    "
  32  Print help info and quit
  33
  34 .BI "\-[no]version"  "no    "
  35  Print version info and quit
  36
  37 .BI "\-nice"  " int" " 19"
  38  Set the nicelevel
  39
  40 .BI "\-r0"  " int" " 1"
  41  The first residue number in the sequence
  42
  43 .BI "\-rot0"  " real" " 0     "
  44  Rotate around an angle initially (90 degrees makes sense)
  45
  46 .BI "\-T"  " string" " "
  47  Plot a title in the center of the wheel (must be shorter than 10 characters, or it will overwrite the wheel)
  48
  49 .BI "\-[no]nn"  "yes   "
  50  Toggle numbers
  51
  52 .SH SEE ALSO
  53 .BR gromacs(7)
  54
  55 More information about \fBGROMACS\fR is available at <\fIhttp://www.gromacs.org/\fR>.