js/source/legacy/solGS/gebvPhenoRegression.js

   1
   2 /**
   3 * breeding values vs phenotypic deviation
   4 * plotting using d3js
   5 * Isaak Y Tecle <iyt2@cornell.edu>
   6 *
   7 */
   8
   9
  10 var solGS = solGS || function solGS() {};
  11
  12 solGS.gebvPhenoRegression = {
  13
  14 gebvPhenoRegCanvasId: '#gebv_pheno_regression_canvas',
  15 gebvPhenoRegPlotDivId: '#gebv_pheno_regression_plot',
  16
  17 checkDataExists: function(args) {
  18
  19     var regArgs = JSON.stringify(args);
  20     var checkData = jQuery.ajax({
  21         type: 'POST',
  22         dataType: 'json',
  23         data: {'arguments': regArgs},
  24         url: '/solgs/check/regression/data/',
  25     });
  26
  27     return checkData;
  28
  29 },
  30
  31
  32 getRegressionData: function(args) {
  33
  34     var regArgs = JSON.stringify(args);
  35
  36    var regData =  jQuery.ajax({
  37         type: 'POST',
  38         dataType: 'json',
  39         data: {'arguments': regArgs},
  40         url: '/solgs/get/regression/data/',
  41     });
  42
  43     return regData;
  44 },
  45
  46 createGebvPhenoDownloadLinks: function () {
  47
  48     var gebvPhenoRegPlotDivId = this.gebvPhenoRegPlotDivId.replace(/#/, '');
  49     var regDownloadBtn = "download_" + gebvPhenoRegPlotDivId;
  50     var regPlotLink = "<a href='#'  onclick='event.preventDefault();' id='" + regDownloadBtn + "'> Regression plot</a>";
  51     var downloadLinks = `Download:  ${regPlotLink}`;
  52
  53     return downloadLinks;
  54
  55   },
  56 }
  57
  58 jQuery(document).ready( function() {
  59     var args = solGS.getModelArgs();
  60     solGS.gebvPhenoRegression.getRegressionData(args).done(function(res){
  61         if (res.status) {
  62
  63             var gebvPhenoRegPlotDivId = solGS.gebvPhenoRegression.gebvPhenoRegPlotDivId;
  64             var canvas = solGS.gebvPhenoRegression.gebvPhenoRegCanvasId;
  65             var downloadLinks = solGS.gebvPhenoRegression.createGebvPhenoDownloadLinks();
  66
  67             var regressionData = {
  68                     'breeding_values'     : res.gebv_data,
  69                     'phenotype_values'    : res.pheno_data,
  70                     'phenotype_deviations': res.pheno_deviations,
  71                     'heritability'        : res.heritability,
  72                     'gebv_pheno_regression_div_id':gebvPhenoRegPlotDivId,
  73                     'canvas':canvas,
  74                     'download_links': downloadLinks
  75             };
  76
  77             jQuery("#gebv_pheno_regression_message").empty();
  78             solGS.scatterPlot.plotRegression(regressionData);
  79         } else {
  80             jQuery("#gebvs_pheno_regression_message").html('There is no GEBVs vs observed phenotypes regression data.');
  81         }
  82     });
  83
  84     solGS.gebvPhenoRegression.getRegressionData(args).fail(function(res){
  85         jQuery("#gebvs_pheno_regression_message").html('Error occured requesting for theGEBVs vs observed phenotypes regression data.');
  86     });
  87
  88
  89     jQuery("#gebv_pheno_regression_canvas").on('click' , 'a', function(e) {
  90                 var buttonId = e.target.id;
  91                 var regPlotId = buttonId.replace(/download_/, '');
  92                 saveSvgAsPng(document.getElementById("#" + regPlotId),  regPlotId + ".png", {scale:1});
  93         });
  94 });
  95
  96
  97
  98
  99
 100
 101
 102
 103
 104