mason/biosource/sample_detail.mas

   1 <%doc>
   2
   3 =head1 NAME
   4
   5  sample_detail.mas
   6  Mason code to get different sections of the sample.pl web_page.
   7
   8 =head1 DESCRIPTION
   9
  10  This mason script coordinate different mason component to create the sample.pl page
  11
  12 =head1 AUTHOR
  13
  14  Aureliano Bombarely (ab782@cornell.edu)
  15
  16 =cut
  17
  18 </%doc>
  19
  20
  21 <%args>
  22 $schema
  23 $sample
  24 $sample_relations_href
  25 $pub_list
  26 $target_list
  27 </%args>
  28
  29 <& /page/page_title.mas, title => 'Data source '.$sample->get_sample_name &>
  30
  31 <&
  32     '/biosource/sample/basic_sample_info.mas',
  33     schema => $schema,
  34     sample => $sample,
  35 &>
  36
  37 <&| /page/info_section.mas,
  38     title => 'Files',
  39     subtitle => 'files available for download',
  40     collapsible => 1,
  41     hide_if_empty => 1,
  42  &>
  43
  44   <& /metadata/downloadable_file_list.mas, %ARGS &>
  45
  46 </&>
  47
  48 <&| /page/info_section.mas, title => 'Related data sources', collapsible => 1, &>
  49   <&
  50       '/chado/relations.mas',
  51       principle         => $sample->get_bssample_row,
  52       relationship_name => 'bs_sample_relationship',
  53       object_type_text  => 'Datasets',
  54       list_component => '/biosource/sample/sample_list.mas',
  55   &>
  56 </&>
  57
  58 % if( @$pub_list ) {
  59   <&
  60      '/biosource/sample/pub_brief.mas',
  61       schema => $schema,
  62       pub_list => $pub_list,
  63   &>
  64 % }
  65
  66 <&
  67     '/biosource/sample/exp_associated.mas',
  68     schema => $schema,
  69     target_list => $target_list,
  70 &>
  71