modified: SpatialOmicsCoord.py
[GalaxyCodeBases.git] / c_cpp / etc / KaKs_Calculator / src / readme
blob5135b83888448224410db456071805052eee2890
1 KaKs_Calculator, Version 1.2
3         1. The source codes of several methods for calculating Ka and Ks. Each method is defined as a C++ class. 
4                 (0) base(.h/.cpp): a base class, including several widely used functions
5                 (1) NG: NG86.h NG86.cpp
6                 (2) LWL, MLWL: LWL85.h LWL85.cpp
7                 (3) LPB, MLPB: LPB93.h LPB93.cpp
8                 (4) GY: GY94.h GY94.cpp
9                 (5) YN: YN00.h YN00.cpp
10                 (6) MYN: MYN.h MYN.cpp
11                 (7) MSMA: MSMA.h MSMA.cpp
12                 
13         2. AXTConverter.cpp
14         AXTConverter is a program for converting Clustal/Msf/Nexus/Phylip/Pir format sequences to AXT ones.
15         
16         3. ConcatenatePairs.cpp
17         Concatenate all pairs of sequences to a pair of sequences.
18         
19 For compiling, just type 'make' command.
20