new file: pixi.toml
[GalaxyCodeBases.git] / etc / salus / openst.yaml
blob86a22a4a298b182504bcb43b63d6e75b13a7a44f
1 name: openst
2 channels:
3     - nvidia
4     - conda-forge
5     - deliangus
6     - https://software.repos.intel.com/python/conda/
7     - nodefaults
8 dependencies:
9     - python>=3.9,<3.12
10     - qtpy
11     - napari
12     - anndata
13     - numpy
14     - scipy
15     - matplotlib
16     - pandas
17     - h5py
18     - tqdm
19     - scikit-learn
20     - natsort
21     - joblib
22     - dask
23     - dask-image
24     - kornia
25     - scikit-image==0.19.3
26     - opencv
27     - cellpose
28     - pyqt
29     - pyqt5-sip
30     - pyqt5-qt5
31     - ome-zarr
32     - napari-ome-zarr
33     - s3fs
34     - fsspec
35     - aiobotocore
36     - botocore
37     - jmespath
38     - pytorch-cuda=12.4
39     - pytorch
40     - torchvision
41     - torchaudio
42     - llvm-openmp
43     - pyqtgraph
44     - pip:
45         - openst