c_cpp/lib/htslib/test/tabix/bed_file.bed

   1 # The MIT License
   2 #
   3 # Copyright (c) 2017 Genome Research Ltd.
   4 #
   5 # Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy
   6 # of this software and associated documentation files (the "Software"), to deal
   7 # in the Software without restriction, including without limitation the rights
   8 # to use, copy, modify, merge, publish, distribute, sublicense, and/or sell
   9 # copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
  10 # furnished to do so, subject to the following conditions:
  11 #
  12 # The above copyright notice and this permission notice shall be included in
  13 # all copies or substantial portions of the Software.
  14 #
  15 # THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR
  16 # IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY,
  17 # FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE
  18 # AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM, DAMAGES OR OTHER
  19 # LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM,
  20 # OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN
  21 # THE SOFTWARE.
  22 #
  23 # Bed format information: https://genome.ucsc.edu/FAQ/FAQformat.html
  24 #
  25 X       1000    1100    X1      500     +       1000    1100    255,0,0
  26 X       1200    1300    X2      500     +       1200    1300    255,0,0
  27 X       1400    1500    X3      500     +       1400    1500    255,0,0
  28 X       1600    1700    X4      500     +       1600    1700    255,0,0
  29 X       1800    1900    X5      500     +       1800    1900    255,0,0
  30 Y       100000  100900  Y1      600     +       100000  100900  255,0,0
  31 Y       100200  100700  Y2      600     +       100200  100700  255,0,0
  32 Y       100400  100500  Y3      600     +       100400  100500  255,0,0
  33 Y       100600  100700  Y4      600     +       100600  100700  255,0,0
  34 Y       100800  100900  Y5      600     +       100800  100900  255,0,0
  35 Z       100000  100001  Z1      600     +       100000  100001  255,0,0
  36 Z       100002  100003  Z2      600     +       100002  100003  255,0,0
  37 Z       100004  100005  Z3      600     +       100004  100005  255,0,0
  38 Z       100006  100007  Z4      600     +       100006  100007  255,0,0
  39 Z       100008  100009  Z5      600     +       100008  100009  255,0,0