c_cpp/lib/htslib/test/test-vcf-hdr.out

   1 ##fileformat=VCFv4.1
   2 ##FILTER=<ID=PASS,Description="All filters passed">
   3 ##fileDate=20150126
   4 ##reference=hs37d5
   5 ##phasing=partial
   6 ##FILTER=<ID=INDEL_SPECIFIC_FILTERS,Description="QD < 2.0 || ReadPosRankSum < -20.0 || InbreedingCoeff < -0.8 || FS > 200.0">
   7 ##FILTER=<ID=LowQual,Description="Low quality">
   8 ##FILTER=<ID=VQSRTrancheSNP99.00to99.90,Description="Truth sensitivity tranche level for SNP model at VQS Lod: -6.6778 <= x < -0.6832">
   9 ##FILTER=<ID=VQSRTrancheSNP99.90to100.00+,Description="Truth sensitivity tranche level for SNP model at VQS Lod < -36469.5723">
  10 ##INFO=<ID=TRAILING,Number=.,Type=Integer,Description="This line contains trailing spaces for testing purposes">
  11 ##FORMAT=<ID=AD,Number=.,Type=Integer,Description="Allelic depths for the ref and alt alleles in the order listed">
  12 ##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Approximate read depth (reads with MQ=255 or with bad mates are filtered)">
  13 ##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,EmptyWithSpace=,Description="Genotype Quality">
  14 ##FORMAT=<ID=GATK,Number=1,Type=String,Description="Genotype as called by GATK. Always a diploid call. All other genotype stats based on this genotype.">
  15 ##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype after Personalis post-processing to match detected chromosome counts.">
  16 #CHROM  POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO    FORMAT  NA00001