c_cpp/readscorr/test.lst

   1 # Estimated Genome Size in M bp
   2 Genome_Size=3000
   3
   4 # Heterozygosity rate
   5 Het=0.01
   6
   7 # DNA sequence error rate
   8 Seq_Err=0.02
   9
  10 # Sequence Depth
  11 Seq_Depth=20
  12
  13 # Mutation to extra kmer effective ratio (that less than 'k' or '2k-1')
  14 Mut_Effect=0.8
  15
  16 [Sequence Files]
  17 ./fullpath/to/fasta.or.fastaq.gz
  18 ./test.seq
  19 test.seq.gz
  20
  21 aend
  22 oend