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[GalaxyCodeBases.git] / projects / radseq / novogene / cmd.lst
blob7703e9f05d78ec26be5ae5358f22445cb32fe88f
1 find -L ./fq/p0 ./fq/wgs ./fq/f1 -name '*.1.fq.gz'|perl -lane '@a=split /\//;$n=pop @a;$p=join "/",@a;$m=$n;$m=~s/.1.fq.gz$//;;print "$p\t$m\t$_"' > ng/fqm.lst
2 mkdir out out/p out/f1
7 qconf -sq tiger.q|grep slots