modified: nfig1.py
[GalaxyCodeBases.git] / BGI / BASE / src / 2bwt / 
treec051c9ebac814d4a9594c01854cf4cb4f1bf531c
drwxr-xr-x   ..
-rw-r--r-- 26171 2BWT-Builder.c
-rw-r--r-- 16847 2BWT-Interface.c
-rw-r--r-- 16315 2BWT-Interface.h
-rw-r--r-- 8060 2BWT-Sample.c
-rw-r--r-- 18969 AsiicBWT2BWT.c
-rw-r--r-- 298460 BWT.c
-rw-r--r-- 21285 BWT.h
-rw-r--r-- 92681 BWTConstruct.c
-rw-r--r-- 4858 BWTConstruct.h
-rw-r--r-- 17376 BWTLoad.c
-rw-r--r-- 2051 BWTLoad.h
-rw-r--r-- 26979 BlastCompare.c
-rw-r--r-- 5342 CacheTest.c
-rw-r--r-- 40121 DNACount.c
-rw-r--r-- 5909 DNACount.h
-rw-r--r-- 3322 FASTAToText.c
-rw-r--r-- 198351 HSP.c
-rw-r--r-- 18755 HSP.h
-rw-r--r-- 12210 HSPstatistic.c
-rw-r--r-- 2522 HSPstatistic.h
-rw-r--r-- 6909 Makefile
-rw-r--r-- 31643 MemManager.c
-rw-r--r-- 6740 MemManager.h
-rw-r--r-- 76372 MiscUtilities.c
-rw-r--r-- 4674 MiscUtilities.h
-rw-r--r-- 14368 QSufSort.c
-rw-r--r-- 1696 QSufSort.h
-rw-r--r-- 22650 SSETest.c
-rw-r--r-- 37390 SearchBWT.c
-rw-r--r-- 8369 Socket.c
-rw-r--r-- 1939 Socket.h
-rw-r--r-- 27002 TextConverter.c
-rw-r--r-- 6441 TextConverter.h
-rw-r--r-- 3812 Timing.c
-rw-r--r-- 1384 Timing.h
-rw-r--r-- 2277 TypeNLimit.h
drwxr-xr-x - b40c
-rw-r--r-- 11310 blast_dust.c
-rw-r--r-- 2573 blast_dust.h
-rw-r--r-- 15809 dictionary.c
-rw-r--r-- 10030 dictionary.h
-rw-r--r-- 23587 iniparser.c
-rw-r--r-- 14393 iniparser.h
-rw-r--r-- 6313 inistrlib.c
-rw-r--r-- 4645 inistrlib.h
-rw-r--r-- 18142 karlin.c
-rw-r--r-- 1666 karlin.h
-rw-r--r-- 2309 lv2_cpu_sort.h
-rw-r--r-- 4054 lv2_gpu_sort.cu
-rw-r--r-- 1258 lv2_gpu_sort.h
-rw-r--r-- 1425 misc.h
-rw-r--r-- 4524 overlap-api.c
-rw-r--r-- 2070 overlap-api.h
-rw-r--r-- 502 printSortedSuffix.cpp
-rw-r--r-- 2858 r250.c
-rw-r--r-- 486 r250.h
-rw-r--r-- 84747 readbwt.cpp