pyproject.toml

   1 [build-system]
   2 requires=['setuptools>=68.0', 'numpy>=1.25,<2.0.0', 'scipy>=1.12', 'cykhash>=2.0,<3.0', 'Cython>=3.0,<3.1', 'scikit-learn>=1.3', 'hmmlearn>=0.3.2']
   3 build-backend = "setuptools.build_meta"
   4
   5 [project]
   6 name = "MACS3"
   7 dynamic = ["version"]
   8 description = "Model Based Analysis for ChIP-Seq data"
   9 authors = [{name = "Tao Liu", email = "vladimir.liu@gmail.com"},
  10            {name = "Philippa Doherty", email = "Philippa.Doherty@RoswellPark.org"}]
  11 readme = "README.md"
  12 requires-python = ">=3.9"
  13 classifiers =['Development Status :: 5 - Production/Stable',
  14               'Environment :: Console',
  15               'Intended Audience :: Developers',
  16               'Intended Audience :: Science/Research',
  17               'License :: OSI Approved :: BSD License',
  18               'Operating System :: MacOS :: MacOS X',
  19               'Operating System :: POSIX',
  20               'Operating System :: Unix',
  21               'Topic :: Scientific/Engineering :: Bio-Informatics',
  22               'Programming Language :: Python :: 3.9',
  23               'Programming Language :: Python :: 3.10',
  24               'Programming Language :: Python :: 3.11',
  25               'Programming Language :: Python :: 3.12',
  26               'Programming Language :: Cython']
  27 dependencies = ["numpy>=1.25,<2.0.0",
  28                 "scipy>=1.12",
  29                 "hmmlearn>=0.3.2",
  30                 "scikit-learn>=1.3",
  31                 "cykhash>=2.0,<3.0"]
  32
  33 [project.urls]
  34 Homepage = "https://https://macs3-project.github.io/MACS/"
  35 Documentation = "https://https://macs3-project.github.io/MACS/"
  36 Repository = "https://github.com/macs3-project/MACS/"
  37 Issues = "https://github.com/macs3-project/MACS/issues"
  38 Changelog = "https://github.com/macs3-project/MACS/blob/master/ChangeLog"