conda/macs3/meta.yaml

   1 {% set name = "macs3" %}
   2 {% set version = "3.0.0b3" %}
   3
   4 package:
   5   name: "{{ name|lower }}"
   6   version: "{{ version }}"
   7
   8 source:
   9   path: ../../
  10
  11 build:
  12   number: 0
  13   skip: True  # [py2k]
  14   script: "{{ PYTHON }} -m pip install . --no-deps --ignore-installed -vvv "
  15
  16 requirements:
  17   build:
  18     - {{ compiler('c') }}
  19     - python >=3.11
  20     - numpy >=1.25
  21     - Cython ~=3.0
  22     - cykhash >=2.0
  23     - setuptools >=68.0
  24     - hmmlearn >=0.3
  25     - scikit-learn >=1.3
  26   host:
  27     - python >=3.11
  28     - numpy >=1.25
  29     - Cython ~=3.0
  30     - cykhash >=2.0
  31   run:
  32     - python >=3.11
  33     - numpy >=1.25
  34     - hmmlearn >=0.3
  35     - scikit-learn >=1.3
  36     - pytest >=7.0
  37
  38 test:
  39   commands:
  40     - macs3 -h
  41     - pytest
  42
  43 about:
  44   home: http://github.com/macs3-project/MACS/
  45   license: BSD
  46   license_family: BSD
  47   license_file: LICENSE
  48   summary: Model Based Analysis for ChIP-Seq data
  49