pkgs/development/python-modules/Cython/default.nix

   1 { lib
   2 , stdenv
   3 , buildPythonPackage
   4 , fetchPypi
   5 , fetchpatch
   6 , python
   7 , pkg-config
   8 , gdb
   9 , numpy
  10 , ncurses
  11 }:
  12
  13 let
  14   excludedTests = [ "reimport_from_subinterpreter" ]
  15     # cython's testsuite is not working very well with libc++
  16     # We are however optimistic about things outside of testsuite still working
  17     ++ lib.optionals (stdenv.cc.isClang or false) [ "cpdef_extern_func" "libcpp_algo" ]
  18     # Some tests in the test suite isn't working on aarch64. Disable them for
  19     # now until upstream finds a workaround.
  20     # Upstream issue here: https://github.com/cython/cython/issues/2308
  21     ++ lib.optionals stdenv.isAarch64 [ "numpy_memoryview" ]
  22     ++ lib.optionals stdenv.isi686 [ "future_division" "overflow_check_longlong" ]
  23   ;
  24
  25 in buildPythonPackage rec {
  26   pname = "cython";
  27   version = "0.29.32";
  28
  29   src = fetchPypi {
  30     pname = "Cython";
  31     inherit version;
  32     hash = "sha256-hzPPR1i3kwTypOOev6xekjQbzke8zrJsElQ5iy+MGvc=";
  33   };
  34
  35   nativeBuildInputs = [
  36     pkg-config
  37   ];
  38
  39   checkInputs = [
  40     gdb numpy ncurses
  41   ];
  42
  43   LC_ALL = "en_US.UTF-8";
  44
  45   patches = [
  46     # backport Cython 3.0 trashcan support (https://github.com/cython/cython/pull/2842) to 0.X series.
  47     # it does not affect Python code unless the code explicitly uses the feature.
  48     # trashcan support is needed to avoid stack overflows during object deallocation in sage (https://trac.sagemath.org/ticket/27267)
  49     (fetchpatch {
  50       name = "trashcan.patch";
  51       url = "https://github.com/cython/cython/commit/f781880b6780117660b2026caadf4a6d7905722f.patch";
  52       sha256 = "sha256-SnjaJdBZxm3O5gJ5Dxut6+eeVtZv+ygUUNwAwgoiFxg=";
  53     })
  54     # The above commit introduces custom trashcan macros, as well as
  55     # compiler changes to use them in Cython-emitted code. The latter
  56     # change is still useful, but the former has been upstreamed as of
  57     # Python 3.8, and the patch below makes Cython use the upstream
  58     # trashcan macros whenever available. This is needed for Python
  59     # 3.11 support, because the API used in Cython's implementation
  60     # changed: https://github.com/cython/cython/pull/4475
  61     (fetchpatch {
  62       name = "disable-trashcan.patch";
  63       url = "https://github.com/cython/cython/commit/e337825cdcf5e94d38ba06a0cb0188e99ce0cc92.patch";
  64       sha256 = "sha256-q0f63eetKrDpmP5Z4v8EuGxg26heSyp/62OYqhRoSso=";
  65     })
  66   ];
  67
  68   checkPhase = ''
  69     export HOME="$NIX_BUILD_TOP"
  70     ${python.interpreter} runtests.py -j$NIX_BUILD_CORES \
  71       --no-code-style \
  72       ${lib.optionalString (builtins.length excludedTests != 0)
  73         ''--exclude="(${builtins.concatStringsSep "|" excludedTests})"''}
  74   '';
  75
  76   # https://github.com/cython/cython/issues/2785
  77   # Temporary solution
  78   doCheck = false;
  79   # doCheck = !stdenv.isDarwin;
  80
  81   meta = {
  82     description = "An optimising static compiler for both the Python programming language and the extended Cython programming language";
  83     homepage = "https://cython.org";
  84     license = lib.licenses.asl20;
  85     maintainers = with lib.maintainers; [ fridh ];
  86   };
  87 }