pkgs/development/python-modules/gpy/default.nix

   1 {
   2   lib,
   3   stdenv,
   4   buildPythonPackage,
   5   fetchFromGitHub,
   6   pythonOlder,
   7   pytestCheckHook,
   8   setuptools,
   9   numpy,
  10   scipy,
  11   six,
  12   paramz,
  13   matplotlib,
  14   cython,
  15 }:
  16
  17 buildPythonPackage rec {
  18   pname = "gpy";
  19   version = "1.13.2";
  20   pyproject = true;
  21
  22   disabled = pythonOlder "3.9";
  23
  24   src = fetchFromGitHub {
  25     owner = "SheffieldML";
  26     repo = "GPy";
  27     rev = "refs/tags/v${version}";
  28     hash = "sha256-kggXePDKJcgw8qwLIBTxbwhiLw2H4dkx7082FguKP0Y=";
  29   };
  30
  31   pythonRelaxDeps = [
  32     "paramz"
  33     "scipy"
  34   ];
  35
  36   nativeBuildInputs = [ setuptools ];
  37   buildInputs = [ cython ];
  38   propagatedBuildInputs = [
  39     numpy
  40     scipy
  41     six
  42     paramz
  43     matplotlib
  44   ];
  45   nativeCheckInputs = [ pytestCheckHook ];
  46
  47   # Rebuild cython-generated .c files to ensure compatibility
  48   preBuild = ''
  49     for fn in $(find . -name '*.pyx'); do
  50       echo $fn | sed 's/\.\.pyx$/\.c/' | xargs ${cython}/bin/cython -3
  51     done
  52   '';
  53
  54   disabledTests = lib.optionals (stdenv.hostPlatform.isDarwin && stdenv.hostPlatform.isx86_64) [
  55     # Rounding difference break comparison
  56     "TestGradientMultiOutputGPModel"
  57   ];
  58
  59   pythonImportsCheck = [ "GPy" ];
  60
  61   meta = with lib; {
  62     description = "Gaussian process framework in Python";
  63     homepage = "https://sheffieldml.github.io/GPy";
  64     changelog = "https://github.com/SheffieldML/GPy/releases/tag/v${version}";
  65     license = licenses.bsd3;
  66     maintainers = with maintainers; [ bcdarwin ];
  67   };
  68 }