pkgs/development/python-modules/medpy/default.nix

   1 {
   2   lib,
   3   buildPythonPackage,
   4   pythonOlder,
   5   fetchFromGitHub,
   6   setuptools,
   7   unittestCheckHook,
   8   boost,
   9   numpy,
  10   scipy,
  11   simpleitk,
  12 }:
  13
  14 buildPythonPackage rec {
  15   pname = "medpy";
  16   version = "0.5.2";
  17   pyproject = true;
  18
  19   disabled = pythonOlder "3.6";
  20
  21   src = fetchFromGitHub {
  22     owner = "loli";
  23     repo = "medpy";
  24     rev = "refs/tags/${version}";
  25     hash = "sha256-M46d8qiR3+ioiuRhzIaU5bV1dnfDm819pjn78RYlcG0=";
  26   };
  27
  28   build-system = [ setuptools ];
  29
  30   dependencies = [
  31     boost
  32     numpy
  33     scipy
  34     simpleitk
  35   ];
  36
  37   nativeCheckInputs = [ unittestCheckHook ];
  38
  39   preCheck = ''
  40     rm -r medpy/  # prevent importing from build directory at test time
  41     rm -r tests/graphcut_  # SIGILL at test time
  42   '';
  43
  44   pythonImportsCheck = [
  45     "medpy"
  46     "medpy.core"
  47     "medpy.features"
  48     "medpy.filter"
  49     "medpy.graphcut"
  50     "medpy.io"
  51     "medpy.metric"
  52     "medpy.utilities"
  53   ];
  54
  55   meta = with lib; {
  56     description = "Medical image processing library";
  57     homepage = "https://loli.github.io/medpy";
  58     changelog = "https://github.com/loli/medpy/releases/tag/${version}";
  59     license = licenses.gpl3Plus;
  60     maintainers = with maintainers; [ bcdarwin ];
  61   };
  62 }