pkgs/development/python-modules/pykdtree/default.nix

   1 {
   2   lib,
   3   buildPythonPackage,
   4   fetchPypi,
   5
   6   # build-system
   7   cython,
   8   numpy,
   9   setuptools,
  10
  11   # native dependencies
  12   openmp,
  13
  14   # tests
  15   pytestCheckHook,
  16 }:
  17
  18 buildPythonPackage rec {
  19   pname = "pykdtree";
  20   version = "1.3.13";
  21   pyproject = true;
  22
  23   src = fetchPypi {
  24     inherit pname version;
  25     hash = "sha256-Osz4UulGZT45nD1Nu+EZ28bT9yz9LVqVyr8L8Mf5JP4=";
  26   };
  27
  28   postPatch = ''
  29     substituteInPlace pyproject.toml \
  30       --replace-warn "numpy>=2.0.0rc1,<3" "numpy"
  31   '';
  32
  33   nativeBuildInputs = [
  34     cython
  35     numpy
  36     setuptools
  37   ];
  38
  39   buildInputs = [ openmp ];
  40
  41   propagatedBuildInputs = [ numpy ];
  42
  43   preCheck = ''
  44     # make sure we don't import pykdtree from the source tree
  45     mv pykdtree/test_tree.py .
  46     rm -rf pykdtree
  47   '';
  48
  49   nativeCheckInputs = [ pytestCheckHook ];
  50
  51   meta = with lib; {
  52     description = "kd-tree implementation for fast nearest neighbour search in Python";
  53     homepage = "https://github.com/storpipfugl/pykdtree";
  54     license = licenses.lgpl3;
  55     maintainers = with maintainers; [ psyanticy ];
  56   };
  57 }