pkgs/development/libraries/science/biology/htslib/default.nix

   1 { lib, stdenv, fetchurl, zlib, bzip2, xz, curl, perl }:
   2
   3 stdenv.mkDerivation rec {
   4   pname = "htslib";
   5   version = "1.11";
   6
   7   src = fetchurl {
   8     url = "https://github.com/samtools/htslib/releases/download/${version}/${pname}-${version}.tar.bz2";
   9     sha256 = "1mrq4mihzx37yqhj3sfz6da6mw49niia808bzsw2gkkgmadxvyng";
  10   };
  11
  12   # perl is only used during the check phase.
  13   nativeBuildInputs = [ perl ];
  14
  15   buildInputs = [ zlib bzip2 xz curl ];
  16
  17   configureFlags = [ "--enable-libcurl" ]; # optional but strongly recommended
  18
  19   installFlags = [ "prefix=$(out)" ];
  20
  21   preCheck = ''
  22     patchShebangs test/
  23   '';
  24
  25   enableParallelBuilding = true;
  26
  27   doCheck = true;
  28
  29   meta = with lib; {
  30     description = "A C library for reading/writing high-throughput sequencing data";
  31     license = licenses.mit;
  32     homepage = "http://www.htslib.org/";
  33     platforms = platforms.unix;
  34     maintainers = [ maintainers.mimame ];
  35   };
  36 }