pkgs/development/ocaml-modules/biotk/default.nix

   1 { lib
   2 , buildDunePackage
   3 , fetchurl
   4 , angstrom-unix
   5 , binning
   6 , ocaml-crunch
   7 , camlzip
   8 , core_kernel
   9 , core_unix ? null
  10 , csvfields ? null
  11 , fmt
  12 , gsl
  13 , ppx_csv_conv ? null
  14 , ppx_deriving
  15 , rresult
  16 , tyxml
  17 , uri
  18 , vg
  19 }:
  20
  21 buildDunePackage rec {
  22   pname = "biotk";
  23   version = "0.3";
  24
  25   minimalOCamlVersion = "4.13";
  26
  27   src = fetchurl {
  28     url = "https://github.com/pveber/biotk/releases/download/v${version}/biotk-${version}.tbz";
  29     hash = "sha256-9eRd3qYteUxu/xNEUER/DHodr6cTCuPtSKr38x32gig=";
  30   };
  31
  32   nativeBuildInputs = [ ocaml-crunch ];
  33
  34   buildInputs = [ ppx_csv_conv ];
  35
  36   propagatedBuildInputs = [
  37     angstrom-unix
  38     binning
  39     camlzip
  40     core_kernel
  41     core_unix
  42     csvfields
  43     fmt
  44     gsl
  45     ppx_deriving
  46     rresult
  47     tyxml
  48     uri
  49     vg
  50   ];
  51
  52   meta = {
  53     description = "Toolkit for bioinformatics in OCaml";
  54     license = lib.licenses.cecill-c;
  55   };
  56 }