pkgs/by-name/em/emboss/package.nix

   1 {
   2   lib,
   3   stdenv,
   4   fetchurl,
   5   readline,
   6   perl,
   7   libharu,
   8   libX11,
   9   libpng,
  10   libXt,
  11   zlib,
  12 }:
  13
  14 stdenv.mkDerivation rec {
  15   pname = "emboss";
  16   version = "6.6.0";
  17
  18   src = fetchurl {
  19     url = "ftp://emboss.open-bio.org/pub/EMBOSS/EMBOSS-${version}.tar.gz";
  20     sha256 = "7184a763d39ad96bb598bfd531628a34aa53e474db9e7cac4416c2a40ab10c6e";
  21   };
  22
  23   buildInputs = [
  24     readline
  25     perl
  26     libharu
  27     libpng
  28     libX11
  29     libXt
  30     zlib
  31   ];
  32
  33   configureFlags = [
  34     "--with-hpdf=${libharu}"
  35     "--with-pngdriver=${zlib}"
  36   ];
  37
  38   postConfigure = ''
  39     sed -i 's@$(bindir)/embossupdate@true@' Makefile
  40   '';
  41
  42   meta = {
  43     description = "European Molecular Biology Open Software Suite";
  44     longDescription = ''
  45       EMBOSS is a free Open Source software analysis package
  46       specially developed for the needs of the molecular biology (e.g. EMBnet)
  47       user community, including libraries. The software automatically copes with
  48       data in a variety of formats and even allows transparent retrieval of
  49       sequence data from the web.
  50     '';
  51     license = lib.licenses.gpl2;
  52     homepage = "https://emboss.sourceforge.net/";
  53   };
  54 }