pkgs/by-name/li/libsbml/package.nix

   1 {
   2   lib,
   3   stdenv,
   4   fetchFromGitHub,
   5   cmake,
   6   pkg-config,
   7   bzip2,
   8   libxml2,
   9   swig,
  10   python ? null,
  11   withPython ? false,
  12 }:
  13 stdenv.mkDerivation (attrs: {
  14   pname = "libsbml";
  15   version = "5.20.4";
  16
  17   src = fetchFromGitHub {
  18     owner = "sbmlteam";
  19     repo = "libsbml";
  20     rev = "v${attrs.version}";
  21     hash = "sha256-qWTN033YU4iWzt+mXQaP5W/6IF5nebF4PwNVkyL8wTg=";
  22   };
  23
  24   nativeBuildInputs = [
  25     cmake
  26     pkg-config
  27     swig
  28   ] ++ lib.optional withPython python.pkgs.pythonImportsCheckHook;
  29
  30   buildInputs = [
  31     bzip2.dev
  32     libxml2
  33   ] ++ lib.optional withPython python;
  34
  35   # libSBML doesn't always make use of pkg-config
  36   cmakeFlags = [
  37     "-DLIBXML_INCLUDE_DIR=${lib.getDev libxml2}/include/libxml2"
  38     "-DLIBXML_LIBRARY=${lib.getLib libxml2}/lib/libxml2${stdenv.hostPlatform.extensions.sharedLibrary}"
  39     "-DPKG_CONFIG_EXECUTABLE=${lib.getBin pkg-config}/bin/pkg-config"
  40     "-DSWIG_EXECUTABLE=${lib.getBin swig}/bin/swig"
  41   ] ++ lib.optional withPython "-DWITH_PYTHON=ON";
  42
  43   postInstall = lib.optional withPython ''
  44     mv $out/${python.sitePackages}/libsbml/libsbml.py $out/${python.sitePackages}/libsbml/__init__.py
  45   '';
  46
  47   pythonImportsCheck = [ "libsbml" ];
  48
  49   meta = with lib; {
  50     description = "Library for manipulating Systems Biology Markup Language (SBML)";
  51     homepage = "https://github.com/sbmlteam/libsbml";
  52     license = licenses.lgpl21Only;
  53     maintainers = [ maintainers.kupac ];
  54     platforms = platforms.all;
  55   };
  56 })