pkgs/by-name/ma/macse/package.nix

   1 {
   2   lib,
   3   stdenv,
   4   fetchurl,
   5   jre,
   6   makeWrapper,
   7 }:
   8
   9 stdenv.mkDerivation rec {
  10   pname = "macse";
  11   version = "2.03";
  12
  13   src = fetchurl {
  14     url = "https://bioweb.supagro.inra.fr/${pname}/releases/${pname}_v${version}.jar";
  15     sha256 = "0jnjyz4f255glg37rawzdv4m6nfs7wfwc5dny7afvx4dz2sv4ssh";
  16   };
  17
  18   nativeBuildInputs = [ makeWrapper ];
  19
  20   dontUnpack = true;
  21   dontBuild = true;
  22
  23   installPhase = ''
  24     runHook preInstall
  25     mkdir -p $out/share/java
  26     cp -s $src $out/share/java/macse.jar
  27     makeWrapper ${jre}/bin/java $out/bin/macse --add-flags "-jar $out/share/java/macse.jar"
  28     runHook postInstall
  29   '';
  30
  31   meta = with lib; {
  32     description = "Multiple alignment of coding sequences";
  33     mainProgram = "macse";
  34     homepage = "https://bioweb.supagro.inra.fr/macse/";
  35     sourceProvenance = with sourceTypes; [ binaryBytecode ];
  36     license = licenses.gpl2;
  37     maintainers = [ maintainers.bzizou ];
  38     platforms = platforms.all;
  39   };
  40 }