pkgs/by-name/mi/minimap2/package.nix

   1 { lib, stdenv, fetchFromGitHub, zlib }:
   2
   3 stdenv.mkDerivation rec {
   4   pname = "minimap2";
   5   version = "2.28";
   6
   7   src = fetchFromGitHub {
   8     repo = pname;
   9     owner = "lh3";
  10     rev = "v${version}";
  11     sha256 = "sha256-cBl2BKgPCP/xHZW6fTH51cY9/lV/1HVLsN7a1R1Blv4=";
  12   };
  13
  14   buildInputs = [ zlib ];
  15
  16   makeFlags = lib.optionals stdenv.hostPlatform.isAarch64 [ "arm_neon=1" "aarch64=1" ];
  17
  18   installPhase = ''
  19     mkdir -p $out/bin
  20     cp minimap2 $out/bin
  21     mkdir -p $out/share/man/man1
  22     cp minimap2.1 $out/share/man/man1
  23   '';
  24
  25   meta = with lib; {
  26     description = "Versatile pairwise aligner for genomic and spliced nucleotide sequences";
  27     mainProgram = "minimap2";
  28     homepage = "https://lh3.github.io/minimap2";
  29     license = licenses.mit;
  30     platforms = platforms.all;
  31     maintainers = [ maintainers.arcadio ];
  32   };
  33 }