pkgs/development/libraries/openbabel/default.nix

   1 {
   2   stdenv,
   3   lib,
   4   fetchFromGitHub,
   5   cmake,
   6   perl,
   7   zlib,
   8   libxml2,
   9   eigen,
  10   python,
  11   cairo,
  12   pcre,
  13   pkg-config,
  14   swig,
  15   rapidjson,
  16   boost,
  17   maeparser,
  18   coordgenlibs,
  19 }:
  20
  21 stdenv.mkDerivation rec {
  22   pname = "openbabel";
  23   version = "unstable-06-12-23";
  24
  25   src = fetchFromGitHub {
  26     owner = "openbabel";
  27     repo = pname;
  28     rev = "32cf131444c1555c749b356dab44fb9fe275271f";
  29     hash = "sha256-V0wrZVrojCZ9Knc5H6cPzPoYWVosRZ6Sn4PX+UFEfHY=";
  30   };
  31
  32   postPatch = ''
  33     sed '1i#include <ctime>' -i include/openbabel/obutil.h # gcc12
  34   '';
  35
  36   buildInputs = [
  37     perl
  38     zlib
  39     libxml2
  40     eigen
  41     python
  42     cairo
  43     pcre
  44     swig
  45     rapidjson
  46     boost
  47     maeparser
  48     coordgenlibs
  49   ];
  50
  51   nativeBuildInputs = [
  52     cmake
  53     pkg-config
  54   ];
  55
  56   preConfigure = ''
  57     cmakeFlagsArray+=(
  58       "-DRUN_SWIG=ON"
  59       "-DPYTHON_BINDINGS=ON"
  60       "-DPYTHON_INSTDIR=$out/${python.sitePackages}"
  61     )
  62   '';
  63
  64   # Setuptools only accepts PEP 440 version strings. The "unstable" identifier
  65   # can not be used. Instead we pretend to be the 3.2 beta release.
  66   postFixup = ''
  67     cat << EOF > $out/${python.sitePackages}/setup.py
  68     from setuptools import setup
  69
  70     setup(
  71         name = 'pyopenbabel',
  72         version = '3.2b1',
  73         packages = ['openbabel'],
  74         package_data = {'openbabel' : ['_openbabel.so']}
  75     )
  76     EOF
  77   '';
  78
  79   meta = with lib; {
  80     description = "Toolbox designed to speak the many languages of chemical data";
  81     homepage = "http://openbabel.org";
  82     platforms = platforms.all;
  83     license = licenses.gpl2Plus;
  84     maintainers = with maintainers; [ danielbarter ];
  85   };
  86 }