pkgs/development/perl-modules/Bio-Ext-Align/default.nix

   1 { lib, buildPerlPackage, fetchFromGitHub }:
   2
   3 buildPerlPackage rec {
   4   pname = "BioExtAlign";
   5   version = "1.5.1";
   6
   7   outputs = [ "out" "dev" ];
   8
   9   src = fetchFromGitHub {
  10     owner = "bioperl";
  11     repo = "bioperl-ext";
  12     rev = "bioperl-ext-release-${lib.replaceStrings ["."] ["-"] version}";
  13     sha256 = "sha256-+0tZ6q3PFem8DWa2vq+njOLmjDvMB0JhD0FGk00lVMA=";
  14   };
  15
  16   patches = [ ./fprintf.patch ];
  17
  18   # Do not install other Bio-ext packages
  19   preConfigure = ''
  20     cd Bio/Ext/Align
  21   '';
  22
  23   # Disable tests as it requires Bio::Tools::Align which is in a different directory
  24   buildPhase = ''
  25     make
  26   '';
  27
  28   meta = {
  29     homepage = "https://github.com/bioperl/bioperl-ext";
  30     description = "Write Perl Subroutines in Other Programming Languages";
  31     longDescription = ''
  32       Part of BioPerl Extensions (BioPerl-Ext) distribution, a collection of Bioperl C-compiled extensions.
  33     '';
  34     license = with lib.licenses; [ artistic1 ];
  35   };
  36 }