pkgs/development/python-modules/hyppo/default.nix

   1 {
   2   lib,
   3   autograd,
   4   buildPythonPackage,
   5   fetchFromGitHub,
   6   future,
   7   matplotlib,
   8   numba,
   9   numpy,
  10   pytestCheckHook,
  11   pythonOlder,
  12   scikit-learn,
  13   scipy,
  14   seaborn,
  15   setuptools,
  16 }:
  17
  18 buildPythonPackage rec {
  19   pname = "hyppo";
  20   version = "0.5.1";
  21   pyproject = true;
  22
  23   disabled = pythonOlder "3.8";
  24
  25   src = fetchFromGitHub {
  26     owner = "neurodata";
  27     repo = "hyppo";
  28     tag = "v${version}";
  29     hash = "sha256-bYxqYSOOifQE3gbw8vNk/A13D5TPx7ERSgFvRHMXKGM=";
  30   };
  31
  32   # some of the doctests (4/21) are broken, e.g. unbound variables, nondeterministic with insufficient tolerance, etc.
  33   # (note upstream's .circleci/config.yml only tests test_*.py files despite their pytest.ini adding --doctest-modules)
  34   postPatch = ''
  35     substituteInPlace pytest.ini --replace-fail "addopts = --doctest-modules" ""
  36   '';
  37
  38   build-system = [ setuptools ];
  39
  40   dependencies = [
  41     autograd
  42     future
  43     numba
  44     numpy
  45     scikit-learn
  46     scipy
  47   ];
  48
  49   nativeCheckInputs = [
  50     pytestCheckHook
  51     matplotlib
  52     seaborn
  53   ];
  54   pytestFlagsArray = [
  55     "hyppo"
  56   ];
  57
  58   meta = with lib; {
  59     homepage = "https://github.com/neurodata/hyppo";
  60     description = "Python package for multivariate hypothesis testing";
  61     changelog = "https://github.com/neurodata/hyppo/releases/tag/v${version}";
  62     license = licenses.mit;
  63     maintainers = with maintainers; [ bcdarwin ];
  64   };
  65 }