pkgs/development/python-modules/nimfa/default.nix

   1 {
   2   lib,
   3   buildPythonPackage,
   4   fetchPypi,
   5   isPy3k,
   6   numpy,
   7   scipy,
   8   matplotlib,
   9   pytestCheckHook,
  10 }:
  11
  12 buildPythonPackage rec {
  13   pname = "nimfa";
  14   version = "1.4.0";
  15   setuptools = true;
  16
  17   src = fetchPypi {
  18     inherit pname version;
  19     hash = "sha256-Oc/yuGhW0Dyoo9nDhZgDTs8adowyX9OnKLuerbjGuRk=";
  20   };
  21
  22   dependencies = [
  23     numpy
  24     scipy
  25   ];
  26
  27   nativeCheckInputs = [
  28     matplotlib
  29     pytestCheckHook
  30   ];
  31
  32   postPatch = ''
  33     substituteInPlace setup.py \
  34       --replace-fail "import imp" "" \
  35       --replace-fail "os.path.exists('.git')" "True" \
  36       --replace-fail "GIT_REVISION = git_version()" "GIT_REVISION = 'v${version}'"
  37   '';
  38
  39   doCheck = !isPy3k; # https://github.com/marinkaz/nimfa/issues/42
  40
  41   meta = {
  42     description = "Nonnegative matrix factorization library";
  43     homepage = "http://nimfa.biolab.si";
  44     license = lib.licenses.bsd3;
  45     maintainers = with lib.maintainers; [ ashgillman ];
  46   };
  47 }