pkgs/development/python-modules/nipy/default.nix

   1 {
   2   lib,
   3   buildPythonPackage,
   4   fetchPypi,
   5
   6   # build-system
   7   cython,
   8   meson-python,
   9   ninja,
  10   setuptools,
  11
  12   # dependencies
  13   numpy,
  14   scipy,
  15   nibabel,
  16   sympy,
  17   transforms3d,
  18
  19   # optional-dependencies
  20   matplotlib,
  21
  22   # tests
  23   pytestCheckHook,
  24 }:
  25
  26 buildPythonPackage rec {
  27   version = "0.6.0";
  28   pname = "nipy";
  29   pyproject = true;
  30
  31   src = fetchPypi {
  32     inherit pname version;
  33     hash = "sha256-BTn2nV4VMeT8bxTOJTHjRU8I2bxFZCzIZCZVn/QcUrk=";
  34   };
  35
  36   postPatch = ''
  37     patchShebangs nipy/_build_utils/cythoner.py
  38   '';
  39
  40   build-system = [
  41     cython
  42     meson-python
  43     setuptools
  44     ninja
  45     numpy
  46   ];
  47
  48   dependencies = [
  49     nibabel
  50     numpy
  51     scipy
  52     sympy
  53     transforms3d
  54   ];
  55
  56   optional-dependencies.optional = [ matplotlib ];
  57
  58   nativeCheckInputs = [ pytestCheckHook ] ++ optional-dependencies.optional;
  59
  60   doCheck = false; # partial imports … circular dependencies. needs more time to figure out.
  61
  62   pythonImportsCheck = [
  63     "nipy"
  64     "nipy.testing"
  65     "nipy.algorithms"
  66   ];
  67
  68   meta = with lib; {
  69     homepage = "https://nipy.org/nipy";
  70     description = "Software for structural and functional neuroimaging analysis";
  71     downloadPage = "https://github.com/nipy/nipy";
  72     license = licenses.bsd3;
  73   };
  74 }