pkgs/development/python-modules/pomegranate/default.nix

   1 {
   2   lib,
   3   buildPythonPackage,
   4   fetchFromGitHub,
   5
   6   # build-system
   7   setuptools,
   8
   9   # dependencies
  10   numpy,
  11   joblib,
  12   networkx,
  13   scipy,
  14   pyyaml,
  15   cython,
  16 }:
  17
  18 buildPythonPackage rec {
  19   pname = "pomegranate";
  20   version = "0.14.8";
  21   pyproject = true;
  22
  23   src = fetchFromGitHub {
  24     repo = pname;
  25     owner = "jmschrei";
  26     # no tags for recent versions: https://github.com/jmschrei/pomegranate/issues/974
  27     rev = "refs/tags/v${version}";
  28     hash = "sha256-PoDAtNm/snq4isotkoCTVYUuwr9AKKwiXIojUFMH/YE=";
  29   };
  30
  31   nativeBuildInputs = [ setuptools ];
  32
  33   propagatedBuildInputs = [
  34     numpy
  35     joblib
  36     networkx
  37     scipy
  38     pyyaml
  39     cython
  40   ];
  41
  42   # https://github.com/etal/cnvkit/issues/815
  43   passthru.skipBulkUpdate = true;
  44
  45   meta = with lib; {
  46     description = "Probabilistic and graphical models for Python, implemented in cython for speed";
  47     homepage = "https://github.com/jmschrei/pomegranate";
  48     license = licenses.mit;
  49     maintainers = with maintainers; [ rybern ];
  50   };
  51 }