pkgs/development/python-modules/pylion/default.nix

   1 {
   2   lib,
   3   buildPythonPackage,
   4   fetchFromBitbucket,
   5   h5py,
   6   termcolor,
   7   pexpect,
   8   jinja2,
   9   sphinxHook,
  10   sphinx-rtd-theme,
  11 }:
  12
  13 buildPythonPackage {
  14   pname = "pylion";
  15   version = "0.5.3";
  16   format = "setuptools";
  17
  18   src = fetchFromBitbucket {
  19     owner = "dtrypogeorgos";
  20     repo = "pylion";
  21     # Version is set in setup.cfg, but not in a git tag / bitbucket release
  22     rev = "3e6b96b542b97107c622d66b0be0551c3bd9f948";
  23     hash = "sha256-c0UOv2Vlv9wJ6YW+QdHinhpdaclUh3As5TDvyoRhpSI=";
  24   };
  25
  26   # Docs are not available online, besides the article:
  27   # http://dx.doi.org/10.1016/j.cpc.2020.107187
  28   nativeBuildInputs = [
  29     sphinxHook
  30     sphinx-rtd-theme
  31   ];
  32
  33   propagatedBuildInputs = [
  34     h5py
  35     termcolor
  36     pexpect
  37     jinja2
  38   ];
  39
  40   pythonImportsCheck = [ "pylion" ];
  41
  42   # Tests fail from some reason - some files seem to be missing from the repo.
  43   doCheck = false;
  44
  45   postInstall = ''
  46     mkdir -p $out/share/doc/$name
  47     cp -r examples $out/share/doc/$name/examples
  48   '';
  49
  50   meta = with lib; {
  51     description = "LAMMPS wrapper for molecular dynamics simulations of trapped ions";
  52     homepage = "https://bitbucket.org/dtrypogeorgos/pylion";
  53     license = licenses.mit;
  54     maintainers = with maintainers; [ doronbehar ];
  55   };
  56 }