pkgs/applications/science/biology/dssp/default.nix

   1 { lib
   2 , stdenv
   3 , cmake
   4 , eigen
   5 , fetchFromGitHub
   6 , libcifpp
   7 , libmcfp
   8 , zlib
   9 }:
  10
  11 stdenv.mkDerivation (finalAttrs: {
  12   pname = "dssp";
  13   version = "4.4.8";
  14
  15   src = fetchFromGitHub {
  16     owner = "PDB-REDO";
  17     repo = "dssp";
  18     rev = "refs/tags/v${finalAttrs.version}";
  19     hash = "sha256-ThQInyVuf8ejkidne/T3GdPBbf3HeThDBwWQEWB+JMI=";
  20   };
  21
  22   nativeBuildInputs = [
  23     cmake
  24   ];
  25
  26   buildInputs = [
  27     eigen
  28     libcifpp
  29     libmcfp
  30     zlib
  31   ];
  32
  33   meta = with lib; {
  34     description = "Calculate the most likely secondary structure assignment given the 3D structure of a protein";
  35     mainProgram = "mkdssp";
  36     homepage = "https://github.com/PDB-REDO/dssp";
  37     changelog = "https://github.com/PDB-REDO/dssp/releases/tag/${lib.removePrefix "refs/tags/" finalAttrs.src.rev}";
  38     license = licenses.bsd2;
  39     maintainers = with maintainers; [ natsukium ];
  40     platforms = platforms.unix;
  41   };
  42 })