pkgs/applications/science/biology/est-sfs/default.nix

   1 { lib, stdenv, fetchurl, gsl }:
   2
   3 stdenv.mkDerivation rec {
   4   pname = "est-sfs";
   5   version = "2.03";
   6
   7   src = fetchurl {
   8     url = "mirror://sourceforge/est-usfs/${pname}-release-${version}.tar.gz";
   9     sha256 = "1hvamrgagz0xi89w8qafyd9mjrdpyika8zm22drddnjkp4sdj65n";
  10   };
  11
  12   buildInputs = [ gsl ];
  13
  14   makeFlags = [
  15     "CC=${stdenv.cc.targetPrefix}cc"
  16   ];
  17
  18   installPhase = ''
  19     mkdir -p $out/bin
  20     mkdir -p $out/share/doc/${pname}
  21     cp est-sfs $out/bin
  22     cp est-sfs-documentation.pdf $out/share/doc/${pname}
  23   '';
  24
  25   meta = with lib; {
  26     homepage = "https://sourceforge.net/projects/est-usfs";
  27     description = "Estimate the unfolded site frequency spectrum and ancestral states";
  28     mainProgram = "est-sfs";
  29     license = licenses.gpl3;
  30     maintainers = [ maintainers.bzizou ];
  31     platforms = platforms.all;
  32   };
  33 }