pkgs/applications/science/biology/trimal/default.nix

   1 { lib, stdenv, fetchFromGitHub }:
   2
   3 stdenv.mkDerivation rec {
   4   pname = "trimal";
   5   version = "1.5.0";
   6
   7   src = fetchFromGitHub {
   8     repo = pname;
   9     owner = "scapella";
  10     rev = "v${version}";
  11     sha256 = "sha256-6GXirih7nY0eD2XS8aplLcYf53EeLuae+ewdUgBiKQQ=";
  12   };
  13
  14   postUnpack = ''
  15     sourceRoot=''${sourceRoot}/source
  16     echo Source root reset to ''${sourceRoot}
  17   '';
  18
  19   installPhase = ''
  20     mkdir -p $out/bin
  21     cp -a trimal readal statal $out/bin
  22   '';
  23
  24   meta = with lib; {
  25     description = "Tool for the automated removal of spurious sequences or poorly aligned regions from a multiple sequence alignment";
  26     license = licenses.gpl3;
  27     platforms = platforms.linux;
  28     homepage = "http://trimal.cgenomics.org";
  29     maintainers = [ maintainers.bzizou ];
  30   };
  31 }