pkgs/development/python-modules/heudiconv/default.nix

   1 { lib
   2 , buildPythonPackage
   3 , datalad
   4 , dcm2niix
   5 , dcmstack
   6 , etelemetry
   7 , fetchPypi
   8 , filelock
   9 , git
  10 , nibabel
  11 , nipype
  12 , pydicom
  13 , pytestCheckHook
  14 , pythonOlder
  15 , setuptools
  16 , versioningit
  17 , wheel
  18 }:
  19
  20 buildPythonPackage rec {
  21   pname = "heudiconv";
  22   version = "1.1.0";
  23   format = "pyproject";
  24
  25   disabled = pythonOlder "3.8";
  26
  27   src = fetchPypi {
  28     inherit pname version;
  29     hash = "sha256-zRLRdP3LpytHCTrehhPYMmJnss5v6ojjkIPuB8fKR5w=";
  30   };
  31
  32   postPatch = ''
  33     substituteInPlace pyproject.toml \
  34       --replace "versioningit ~=" "versioningit >="
  35   '';
  36
  37   nativeBuildInputs = [
  38     setuptools
  39     versioningit
  40     wheel
  41   ];
  42
  43   propagatedBuildInputs = [
  44     nibabel
  45     pydicom
  46     nipype
  47     dcmstack
  48     etelemetry
  49     filelock
  50   ];
  51
  52   nativeCheckInputs = [
  53     datalad
  54     dcm2niix
  55     pytestCheckHook
  56     git
  57   ];
  58
  59   preCheck = ''
  60     export HOME=$(mktemp -d)
  61   '';
  62
  63   pythonImportsCheck = [
  64     "heudiconv"
  65   ];
  66
  67   meta = with lib; {
  68     homepage = "https://heudiconv.readthedocs.io";
  69     description = "Flexible DICOM converter for organizing imaging data";
  70     changelog = "https://github.com/nipy/heudiconv/releases/tag/v${version}";
  71     license = licenses.asl20;
  72     maintainers = with maintainers; [ bcdarwin ];
  73   };
  74 }