pkgs/development/python-modules/mahotas/default.nix

   1 { buildPythonPackage
   2 , fetchFromGitHub
   3 , fetchpatch
   4 , pillow
   5 , scipy
   6 , numpy
   7 , pytestCheckHook
   8 , imread
   9 , freeimage
  10 , lib
  11 , stdenv
  12 }:
  13
  14 buildPythonPackage rec {
  15   pname = "mahotas";
  16   version = "1.4.13";
  17   format = "setuptools";
  18
  19   src = fetchFromGitHub {
  20     owner = "luispedro";
  21     repo = "mahotas";
  22     rev = "v${version}";
  23     hash = "sha256-AmctF/9hLgHw6FUm0s61eCdcc12lBa1t0OkXclis//w=";
  24   };
  25
  26   propagatedBuildInputs = [
  27     freeimage
  28     imread
  29     numpy
  30     pillow
  31     scipy
  32   ];
  33
  34   nativeCheckInputs = [ pytestCheckHook ];
  35
  36   postPatch = ''
  37     substituteInPlace mahotas/io/freeimage.py \
  38       --replace "ctypes.util.find_library('freeimage')" 'True' \
  39       --replace 'ctypes.CDLL(libname)' 'np.ctypeslib.load_library("libfreeimage", "${freeimage}/lib")'
  40   '';
  41
  42   # mahotas/_morph.cpp:864:10: error: no member named 'random_shuffle' in namespace 'std'
  43   env = lib.optionalAttrs stdenv.cc.isClang {
  44     NIX_CFLAGS_COMPILE = "-std=c++14";
  45   };
  46
  47   # tests must be run in the build directory
  48   preCheck = ''
  49     cd build/lib*
  50   '';
  51
  52   # re-enable as soon as https://github.com/luispedro/mahotas/issues/97 is fixed
  53   disabledTests = [
  54     "test_colors"
  55     "test_ellipse_axes"
  56     "test_normalize"
  57     "test_haralick3d"
  58   ];
  59
  60   pythonImportsCheck = [
  61     "mahotas"
  62     "mahotas.freeimage"
  63   ];
  64
  65   disabled = stdenv.isi686; # Failing tests
  66
  67   meta = with lib; {
  68     broken = (stdenv.isLinux && stdenv.isAarch64);
  69     description = "Computer vision package based on numpy";
  70     homepage = "https://mahotas.readthedocs.io/";
  71     maintainers = with maintainers; [ luispedro ];
  72     license = licenses.mit;
  73     platforms = platforms.unix;
  74   };
  75 }