pkgs/development/python-modules/medpy/default.nix

   1 { lib
   2 , buildPythonPackage
   3 , pythonOlder
   4 , fetchFromGitHub
   5 , setuptools
   6 , unittestCheckHook
   7 , boost
   8 , numpy
   9 , scipy
  10 , simpleitk
  11 }:
  12
  13 buildPythonPackage rec {
  14   pname = "medpy";
  15   version = "0.5.1";
  16   pyproject = true;
  17
  18   disabled = pythonOlder "3.6";
  19
  20   src = fetchFromGitHub {
  21     owner = "loli";
  22     repo = "medpy";
  23     rev = "refs/tags/${version}";
  24     hash = "sha256-kzOTYBcXAAEYoe/m/BjWNaQX4ljG17NxndevAt5KxjQ=";
  25   };
  26
  27   build-system = [
  28     setuptools
  29   ];
  30
  31   dependencies = [
  32     boost
  33     numpy
  34     scipy
  35     simpleitk
  36   ];
  37
  38   nativeCheckInputs = [
  39     unittestCheckHook
  40   ];
  41
  42   preCheck = ''
  43     rm -r medpy/  # prevent importing from build directory at test time
  44     rm -r tests/graphcut_  # SIGILL at test time
  45   '';
  46
  47   pythonImportsCheck = [
  48     "medpy"
  49     "medpy.core"
  50     "medpy.features"
  51     "medpy.filter"
  52     "medpy.graphcut"
  53     "medpy.io"
  54     "medpy.metric"
  55     "medpy.utilities"
  56   ];
  57
  58   meta = with lib; {
  59     description = "Medical image processing library";
  60     homepage = "https://loli.github.io/medpy";
  61     changelog = "https://github.com/loli/medpy/releases/tag/${version}";
  62     license = licenses.gpl3Plus;
  63     maintainers = with maintainers; [ bcdarwin ];
  64   };
  65 }