pkgs/development/python-modules/ripser/default.nix

   1 { lib
   2 , buildPythonPackage
   3 , fetchPypi
   4 , pythonOlder
   5 , cython
   6 , numpy
   7 , scipy
   8 , scikitlearn
   9 , persim
  10 , pytest
  11 }:
  12
  13 buildPythonPackage rec {
  14   pname = "ripser";
  15   version = "0.6.0";
  16   disabled = pythonOlder "3.6";
  17
  18   src = fetchPypi {
  19     inherit pname version;
  20     sha256 = "5c47deffbf9e163186b0997f2d59486d96a7c65766e76500f754fadfbc89f5d9";
  21   };
  22
  23   checkInputs = [
  24     pytest
  25   ];
  26
  27   propagatedBuildInputs = [
  28     cython
  29     numpy
  30     scipy
  31     scikitlearn
  32     persim
  33   ];
  34
  35   checkPhase = ''
  36     # specifically needed for darwin
  37     export HOME=$(mktemp -d)
  38     mkdir -p $HOME/.matplotlib
  39     echo "backend: ps" > $HOME/.matplotlib/matplotlibrc
  40
  41     pytest
  42   '';
  43
  44   meta = with lib; {
  45     description = "A Lean Persistent Homology Library for Python";
  46     homepage = "https://ripser.scikit-tda.org";
  47     license = licenses.mit;
  48     maintainers = [ maintainers.costrouc ];
  49   };
  50 }