html/pontus/llp_synopsis.php

   1     <h3 class="heading1">llp</h3>
   2
   3       Perl script for log-likelihood profiling of NONMEM runs.
   4
   5     <h3 class="heading1">Usage:</h3>
   6 <pre>   llp [ -h | -? ] [ --help ]
   7               --omegas='omega list'
   8               --sigmas='sigma list'
   9               --thetas='theta list'
  10             [ --max_iterations='integer' ]
  11             [ --normq='number' ]
  12             [ --ofv_increase='number' ]
  13             [ --outputfile='string' ]
  14             [ --rse_omegas='omega rel. SE list' ]
  15             [ --rse_sigmas='sigma rel. SE list' ]
  16             [ --rse_thetas='theta rel. SE list' ]
  17             [ --significant_digits='integer' ]
  18             [ --abort_on_fail ]
  19             [ --clean=0 ]
  20             [ --compress ]
  21             [ --condition_number_limit='number' ]
  22             [ --correlation_limit='number' ]
  23             [ --cpu_time='integer' ]
  24             [ --debug=0 ]
  25             [ --debug_package='string' ]
  26             [ --debug_subroutine='string' ]
  27             [ --directory='string' ]
  28             [ --drop_dropped ]
  29             [ --extra_data_files='string' ]
  30             [ --extra_files='string' ]
  31             [ --grid_batch_size='integer' ]
  32             [ --grid_poll_interval='integer' ]
  33             [ --handle_maxevals ]
  34             [ --html_help ]
  35             [ --large_omega_cv_limit='number' ]
  36             [ --large_sigma_cv_limit='number' ]
  37             [ --large_theta_cv_limit='number' ]
  38             [ --lsf_job_name='string' ]
  39             [ --lsf_options='string' ]
  40             [ --lsf_project_name='string' ]
  41             [ --lsf_queue='string' ]
  42             [ --lsf_resources='string' ]
  43             [ --lsf_ttl='string' ]
  44             [ --missing_data_token='string' ]
  45             [ --near_bound_sign_digits='integer' ]
  46             [ --near_zero_boundary_limit='number' ]
  47             [ --nice='integer' ]
  48             [ --nm_directory='string' ]
  49             [ --nm_version='string' ]
  50             [ --no_remote_compile ]
  51             [ --no_remote_execution ]
  52             [ --outputfile='string' ]
  53             [ --picky ]
  54             [ --project='string' ]
  55             [ --remove_temp_files ]
  56             [ --results_file='string' ]
  57             [ --retries='integer' ]
  58             [ --run_on_lsf ]
  59             [ --run_on_nordugrid ]
  60             [ --sde ]
  61             [ --seed='string' ]
  62             [ --sign_digits_off_diagonals='integer' ]
  63             [ --significant_digits_rerun='number' ]
  64             [ --silent ]
  65             [ --submit_self ]
  66             [ --summarize ]
  67             [ --threads='integer' ]
  68             [ --tweak_inits=1 ]
  69             [ --user='string' ]
  70             [ --warn_with_trace='integer' ]
  71             [ --wrap_data ]
  72             </pre>