updated top-level README and version_decl for V4.5 (#1847)
[WRF.git] / phys / module_cam_bl_diffusion_solver.F
blob98a87ddac81a7d1d01082e3fcd9a87e4caf716e2
1 #define WRF_PORT
2 #define MODAL_AERO
3 ! Updated to CESM1.0.3 (CAM5.1.01) by Balwinder.Singh@pnnl.gov
4   module diffusion_solver
6   !------------------------------------------------------------------------------------ !
7   ! Module to solve vertical diffusion equations using a tri-diagonal solver.           !
8   ! The module will also apply countergradient fluxes, and apply molecular              ! 
9   ! diffusion for constituents.                                                         !
10   !                                                                                     !
11   ! Public interfaces :                                                                 ! 
12   !    init_vdiff       initializes time independent coefficients                       !
13   !    compute_vdiff    solves diffusion equations                                      !
14   !    vd_lu_solve      tridiagonal solver also used by gwd (should be private)         !
15   !    vd_lu_decomp     tridiagonal solver also used by gwd (should be private)         !
16   !    vdiff_selector   type for storing fields selected to be diffused                 !
17   !    vdiff_select     selects fields to be diffused                                   !
18   !    operator(.not.)  extends .not. to operate on type vdiff_selector                 !
19   !    any              provides functionality of intrinsic any for type vdiff_selector !
20   !                                                                                     !
21   !------------------------------------ Code History ---------------------------------- !
22   ! Initial subroutines :  B. Boville and others, 1991-2004                             !
23   ! Modularization      :  J. McCaa, September 2004                                     !
24   ! Most Recent Code    :  Sungsu Park, Aug. 2006, Dec. 2008, Jan. 2010.                !
25   !------------------------------------------------------------------------------------ !
26 #ifndef WRF_PORT
27   use cam_logfile,   only : iulog
28 #else
29   use module_cam_support,   only : iulog
30 #endif
32   implicit none
33   private       
34   save
36   integer, parameter :: r8 = selected_real_kind(12)      ! 8 byte real
38   ! ----------------- !
39   ! Public interfaces !
40   ! ----------------- !
42   public init_vdiff                                      ! Initialization
43   public compute_vdiff                                   ! Full routine
44   public vd_lu_solve                                     ! Tridiagonal solver also used by gwd ( should be private! )
45   public vd_lu_decomp                                    ! Tridiagonal solver also used by gwd ( should be private! )
46   public vdiff_selector                                  ! Type for storing fields selected to be diffused
47   public vdiff_select                                    ! Selects fields to be diffused
48   public operator(.not.)                                 ! Extends .not. to operate on type vdiff_selector
49   public any                                             ! Provides functionality of intrinsic any for type vdiff_selector
51   integer, public   :: nbot_molec                        ! Bottom level where molecular diffusivity is applied
53   ! Below stores logical array of fields to be diffused
55   type vdiff_selector 
56        private
57        logical, pointer, dimension(:) :: fields
58   end type vdiff_selector
60   ! Below extends .not. to operate on type vdiff_selector
62   interface operator(.not.)
63        module procedure not
64   end interface
66   ! Below provides functionality of intrinsic any for type vdiff_selector
68   interface any                           
69        module procedure my_any
70   end interface
72   ! ------------ !
73   ! Private data !
74   ! ------------ !
76   real(r8), private   :: cpair                           ! Specific heat of dry air
77   real(r8), private   :: gravit                          ! Acceleration due to gravity
78   real(r8), private   :: rair                            ! Gas constant for dry air
79   real(r8), private   :: zvir                            ! rh2o/rair - 1
80   real(r8), private   :: latvap                          ! Latent heat of vaporization
81   real(r8), private   :: karman                          ! von Karman constant
83   ! Parameters used for Turbulent Mountain Stress
85   real(r8), parameter :: z0fac   = 0.025_r8              ! Factor determining z_0 from orographic standard deviation
86   real(r8), parameter :: z0max   = 100._r8               ! Max value of z_0 for orography
87   real(r8), parameter :: horomin = 10._r8                ! Min value of subgrid orographic height for mountain stress
88   real(r8), parameter :: dv2min  = 0.01_r8               ! Minimum shear squared
89   real(r8), private   :: oroconst                        ! Converts from standard deviation to height
91   contains
93   ! =============================================================================== !
94   !                                                                                 !
95   ! =============================================================================== !
97   subroutine init_vdiff( kind, ncnst, rair_in, gravit_in, fieldlist_wet, fieldlist_dry, errstring )
99     integer,              intent(in)  :: kind            ! Kind used for reals
100     integer,              intent(in)  :: ncnst           ! Number of constituents
101     real(r8),             intent(in)  :: rair_in         ! Input gas constant for dry air
102     real(r8),             intent(in)  :: gravit_in       ! Input gravititational acceleration
103     type(vdiff_selector), intent(out) :: fieldlist_wet   ! List of fields to be diffused using moist mixing ratio
104     type(vdiff_selector), intent(out) :: fieldlist_dry   ! List of fields to be diffused using dry   mixing ratio
105     character(128),       intent(out) :: errstring       ! Output status
106     
107     errstring = ''
108     if( kind .ne. r8 ) then
109         write(iulog,*) 'KIND of reals passed to init_vdiff -- exiting.'
110 #ifdef WRF_PORT
111         call wrf_message(iulog)
112 #endif        
113         errstring = 'init_vdiff'
114         return
115     endif
117     rair   = rair_in     
118     gravit = gravit_in 
120     allocate( fieldlist_wet%fields( 3 + ncnst ) )
121     fieldlist_wet%fields(:) = .false.
123     allocate( fieldlist_dry%fields( 3 + ncnst ) )
124     fieldlist_dry%fields(:) = .false.
126   end subroutine init_vdiff
128   ! =============================================================================== !
129   !                                                                                 !
130   ! =============================================================================== !
132   subroutine compute_vdiff( lchnk           ,                                                                   &
133                             pcols           , pver               , ncnst         , ncol         , pmid        , &
134                             pint            , rpdel              , t             , ztodt        , taux        , &
135                             tauy            , shflx              , cflx          , ntop         , nbot        , &
136                             kvh             , kvm                , kvq           , cgs          , cgh         , &
137                             zi              , ksrftms            , qmincg        , fieldlist    ,               &
138                             u               , v                  , q             , dse          ,               &
139                             tautmsx         , tautmsy            , dtk           , topflx       , errstring   , &
140                             tauresx         , tauresy            , itaures       ,                              &
141                             do_molec_diff   , compute_molec_diff , vd_lu_qdecomp )
143     !-------------------------------------------------------------------------- !
144     ! Driver routine to compute vertical diffusion of momentum, moisture, trace !
145     ! constituents and dry static energy. The new temperature is computed from  !
146     ! the diffused dry static energy.                                           ! 
147     ! Turbulent diffusivities and boundary layer nonlocal transport terms are   !
148     ! obtained from the turbulence module.                                      !
149     !-------------------------------------------------------------------------- !
150 #ifndef WRF_PORT 
151     use phys_debug_util,    only : phys_debug_col
152     use time_manager,       only : is_first_step, get_nstep
153     use phys_control,       only : phys_getopts
154 #endif
155   
156   ! Modification : Ideally, we should diffuse 'liquid-ice static energy' (sl), not the dry static energy.
157   !                Also, vertical diffusion of cloud droplet number concentration and aerosol number
158   !                concentration should be done very carefully in the future version.
160     ! --------------- !
161     ! Input Arguments !
162     ! --------------- !
164     integer,  intent(in)    :: lchnk                   
165     integer,  intent(in)    :: pcols
166     integer,  intent(in)    :: pver
167     integer,  intent(in)    :: ncnst
168     integer,  intent(in)    :: ncol                      ! Number of atmospheric columns
169     integer,  intent(in)    :: ntop                      ! Top    interface level to which vertical diffusion is applied ( = 1 ).
170     integer,  intent(in)    :: nbot                      ! Bottom interface level to which vertical diffusion is applied ( = pver ).
171     integer,  intent(in)    :: itaures                   ! Indicator determining whether 'tauresx,tauresy' is updated (1) or non-updated (0) in this subroutine.   
173     real(r8), intent(in)    :: pmid(pcols,pver)          ! Mid-point pressures [ Pa ]
174     real(r8), intent(in)    :: pint(pcols,pver+1)        ! Interface pressures [ Pa ]
175     real(r8), intent(in)    :: rpdel(pcols,pver)         ! 1./pdel
176     real(r8), intent(in)    :: t(pcols,pver)             ! Temperature [ K ]
177     real(r8), intent(in)    :: ztodt                     ! 2 delta-t [ s ]
178     real(r8), intent(in)    :: taux(pcols)               ! Surface zonal      stress. Input u-momentum per unit time per unit area into the atmosphere [ N/m2 ]
179     real(r8), intent(in)    :: tauy(pcols)               ! Surface meridional stress. Input v-momentum per unit time per unit area into the atmosphere [ N/m2 ]
180     real(r8), intent(in)    :: shflx(pcols)              ! Surface sensible heat flux [ W/m2 ]
181     real(r8), intent(in)    :: cflx(pcols,ncnst)         ! Surface constituent flux [ kg/m2/s ]
182     real(r8), intent(in)    :: zi(pcols,pver+1)          ! Interface heights [ m ]
183     real(r8), intent(in)    :: ksrftms(pcols)            ! Surface drag coefficient for turbulent mountain stress. > 0. [ kg/s/m2 ]
184     real(r8), intent(in)    :: qmincg(ncnst)             ! Minimum constituent mixing ratios from cg fluxes
186     logical,  intent(in)         :: do_molec_diff        ! Flag indicating multiple constituent diffusivities
187     integer,  external, optional :: compute_molec_diff   ! Constituent-independent moleculuar diffusivity routine
188     integer,  external, optional :: vd_lu_qdecomp        ! Constituent-dependent moleculuar diffusivity routine
189     type(vdiff_selector), intent(in) :: fieldlist        ! Array of flags selecting which fields to diffuse
191     ! ---------------------- !
192     ! Input-Output Arguments !
193     ! ---------------------- !
195     real(r8), intent(inout) :: kvh(pcols,pver+1)         ! Eddy diffusivity for heat [ m2/s ]
196     real(r8), intent(inout) :: kvm(pcols,pver+1)         ! Eddy viscosity ( Eddy diffusivity for momentum ) [ m2/s ]
197     real(r8), intent(inout) :: kvq(pcols,pver+1)         ! Eddy diffusivity for constituents
198     real(r8), intent(inout) :: cgs(pcols,pver+1)         ! Counter-gradient star [ cg/flux ]
199     real(r8), intent(inout) :: cgh(pcols,pver+1)         ! Counter-gradient term for heat
201     real(r8), intent(inout) :: u(pcols,pver)             ! U wind. This input is the 'raw' input wind to PBL scheme without iterative provisional update. [ m/s ]
202     real(r8), intent(inout) :: v(pcols,pver)             ! V wind. This input is the 'raw' input wind to PBL scheme without iterative provisional update. [ m/s ]
203     real(r8), intent(inout) :: q(pcols,pver,ncnst)       ! Moisture and trace constituents [ kg/kg, #/kg ? ]
204     real(r8), intent(inout) :: dse(pcols,pver)           ! Dry static energy [ J/kg ]
206     real(r8), intent(inout) :: tauresx(pcols)            ! Input  : Reserved surface stress at previous time step
207     real(r8), intent(inout) :: tauresy(pcols)            ! Output : Reserved surface stress at current  time step
209     ! ---------------- !
210     ! Output Arguments !
211     ! ---------------- !
213     real(r8), intent(out)   :: dtk(pcols,pver)           ! T tendency from KE dissipation
214     real(r8), intent(out)   :: tautmsx(pcols)            ! Implicit zonal      turbulent mountain surface stress [ N/m2 = kg m/s /s/m2 ]
215     real(r8), intent(out)   :: tautmsy(pcols)            ! Implicit meridional turbulent mountain surface stress [ N/m2 = kg m/s /s/m2 ]
216     real(r8), intent(out)   :: topflx(pcols)             ! Molecular heat flux at the top interface
217     character(128), intent(out) :: errstring             ! Output status
219     ! --------------- !
220     ! Local Variables ! 
221     ! --------------- !
223     integer  :: i, k, m, icol                            ! Longitude, level, constituent indices
224     integer  :: status                                   ! Status indicator
225     integer  :: ntop_molec                               ! Top level where molecular diffusivity is applied
226     logical  :: lqtst(pcols)                             ! Adjust vertical profiles
227     logical  :: need_decomp                              ! Whether to compute a new decomposition
228     logical  :: cnst_fixed_ubc(ncnst)                    ! Whether upper boundary condition is fixed
229     logical  :: do_iss                                   ! Use implicit turbulent surface stress computation
231     real(r8) :: tmpm(pcols,pver)                         ! Potential temperature, ze term in tri-diag sol'n
232     real(r8) :: ca(pcols,pver)                           ! - Upper diag of tri-diag matrix
233     real(r8) :: cc(pcols,pver)                           ! - Lower diag of tri-diag matrix
234     real(r8) :: dnom(pcols,pver)                         ! 1./(1. + ca(k) + cc(k) - cc(k)*ze(k-1))
236     real(r8) :: tmp1(pcols)                              ! Temporary storage
237     real(r8) :: tmpi1(pcols,pver+1)                      ! Interface KE dissipation
238     real(r8) :: tint(pcols,pver+1)                       ! Interface temperature
239     real(r8) :: rhoi(pcols,pver+1)                       ! rho at interfaces
240     real(r8) :: tmpi2(pcols,pver+1)                      ! dt*(g*rho)**2/dp at interfaces
241     real(r8) :: rrho(pcols)                              ! 1./bottom level density 
243     real(r8) :: zero(pcols)                              ! Zero array for surface heat exchange coefficients 
244     real(r8) :: tautotx(pcols)                           ! Total surface stress ( zonal )
245     real(r8) :: tautoty(pcols)                           ! Total surface stress ( meridional )
247     real(r8) :: dinp_u(pcols,pver+1)                     ! Vertical difference at interfaces, input u
248     real(r8) :: dinp_v(pcols,pver+1)                     ! Vertical difference at interfaces, input v
249     real(r8) :: dout_u                                   ! Vertical difference at interfaces, output u
250     real(r8) :: dout_v                                   ! Vertical difference at interfaces, output v
251     real(r8) :: dse_top(pcols)                           ! dse on top boundary
252     real(r8) :: cc_top(pcols)                            ! Lower diagonal at top interface
253     real(r8) :: cd_top(pcols)                            ! 
254     real(r8) :: rghd(pcols,pver+1)                       ! (1/H_i - 1/H) *(g*rho)^(-1)
256     real(r8) :: qtm(pcols,pver)                          ! Temporary copy of q
257     real(r8) :: kq_scal(pcols,pver+1)                    ! kq_fac*sqrt(T)*m_d/rho for molecular diffusivity
258     real(r8) :: mw_fac(ncnst)                            ! sqrt(1/M_q + 1/M_d) for this constituent
259     real(r8) :: cnst_mw(ncnst)                           ! Molecular weight [ kg/kmole ]
260     real(r8) :: ubc_mmr(pcols,ncnst)                     ! Upper boundary mixing ratios [ kg/kg ]
261     real(r8) :: ubc_t(pcols)                             ! Upper boundary temperature [ K ]
263     real(r8) :: ws(pcols)                                ! Lowest-level wind speed [ m/s ]
264     real(r8) :: tau(pcols)                               ! Turbulent surface stress ( not including mountain stress )
265     real(r8) :: ksrfturb(pcols)                          ! Surface drag coefficient of 'normal' stress. > 0. Virtual mass input per unit time per unit area [ kg/s/m2 ]
266     real(r8) :: ksrf(pcols)                              ! Surface drag coefficient of 'normal' stress + Surface drag coefficient of 'tms' stress.  > 0. [ kg/s/m2 ] 
267     real(r8) :: usum_in(pcols)                           ! Vertical integral of input u-momentum. Total zonal     momentum per unit area in column  [ sum of u*dp/g = kg m/s m-2 ]
268     real(r8) :: vsum_in(pcols)                           ! Vertical integral of input v-momentum. Total meridional momentum per unit area in column [ sum of v*dp/g = kg m/s m-2 ]
269     real(r8) :: usum_mid(pcols)                          ! Vertical integral of u-momentum after adding explicit residual stress
270     real(r8) :: vsum_mid(pcols)                          ! Vertical integral of v-momentum after adding explicit residual stress
271     real(r8) :: usum_out(pcols)                          ! Vertical integral of u-momentum after doing implicit diffusion
272     real(r8) :: vsum_out(pcols)                          ! Vertical integral of v-momentum after doing implicit diffusion
273     real(r8) :: tauimpx(pcols)                           ! Actual net stress added at the current step other than mountain stress
274     real(r8) :: tauimpy(pcols)                           ! Actual net stress added at the current step other than mountain stress
275     real(r8) :: wsmin                                    ! Minimum sfc wind speed for estimating frictional transfer velocity ksrf. [ m/s ]
276     real(r8) :: ksrfmin                                  ! Minimum surface drag coefficient [ kg/s/m^2 ]
277     real(r8) :: timeres                                  ! Relaxation time scale of residual stress ( >= dt ) [ s ]
278     real(r8) :: ramda                                    ! dt/timeres [ no unit ]
279     real(r8) :: psum
280     real(r8) :: u_in, u_res, tauresx_in
281     real(r8) :: v_in, v_res, tauresy_in  
283     ! ------------------------------------------------ !
284     ! Parameters for implicit surface stress treatment !
285     ! ------------------------------------------------ !
287     wsmin    = 1._r8                                     ! Minimum wind speed for ksrfturb computation        [ m/s ]
288     ksrfmin  = 1.e-4_r8                                  ! Minimum surface drag coefficient                   [ kg/s/m^2 ]
289     timeres  = 7200._r8                                  ! Relaxation time scale of residual stress ( >= dt ) [ s ]
290 #ifndef WRF_PORT 
291     call phys_getopts( do_iss_out = do_iss )
292 #else
293     do_iss = .true. !hardwired to true
294 #endif
296     ! ----------------------- !
297     ! Main Computation Begins !
298     ! ----------------------- !
300     errstring = ''
301     if( ( diffuse(fieldlist,'u') .or. diffuse(fieldlist,'v') ) .and. .not. diffuse(fieldlist,'s') ) then
302           errstring = 'diffusion_solver.compute_vdiff: must diffuse s if diffusing u or v'
303           return
304     end if
305     zero(:) = 0._r8
307     ! Compute 'rho' and 'dt*(g*rho)^2/dp' at interfaces
309     tint(:ncol,1) = t(:ncol,1)
310     rhoi(:ncol,1) = pint(:ncol,1) / (rair*tint(:ncol,1))
311     do k = 2, pver
312        do i = 1, ncol
313           tint(i,k)  = 0.5_r8 * ( t(i,k) + t(i,k-1) )
314           rhoi(i,k)  = pint(i,k) / (rair*tint(i,k))
315           tmpi2(i,k) = ztodt * ( gravit*rhoi(i,k) )**2 / ( pmid(i,k) - pmid(i,k-1) )
316        end do
317     end do
318     tint(:ncol,pver+1) = t(:ncol,pver)
319     rhoi(:ncol,pver+1) = pint(:ncol,pver+1) / ( rair*tint(:ncol,pver+1) )
321     rrho(:ncol) = rair  * t(:ncol,pver) / pmid(:ncol,pver)
322     tmp1(:ncol) = ztodt * gravit * rpdel(:ncol,pver)
324     !--------------------------------------- !
325     ! Computation of Molecular Diffusivities !
326     !--------------------------------------- !
328   ! Modification : Why 'kvq' is not changed by molecular diffusion ? 
330     if( do_molec_diff ) then
332         if( (.not.present(compute_molec_diff)) .or. (.not.present(vd_lu_qdecomp)) ) then
333               errstring = 'compute_vdiff: do_molec_diff true but compute_molec_diff or vd_lu_qdecomp missing'
334               return
335         endif
337       ! The next subroutine 'compute_molec_diff' :
338       !     Modifies : kvh, kvm, tint, rhoi, and tmpi2
339       !     Returns  : kq_scal, ubc_t, ubc_mmr, dse_top, cc_top, cd_top, cnst_mw, 
340       !                cnst_fixed_ubc , mw_fac , ntop_molec 
342         status = compute_molec_diff( lchnk          ,                                                                &
343                                      pcols          , pver    , ncnst      , ncol      , t      , pmid   , pint    , &
344                                      zi             , ztodt   , kvh        , kvm       , tint   , rhoi   , tmpi2   , &
345                                      kq_scal        , ubc_t   , ubc_mmr    , dse_top   , cc_top , cd_top , cnst_mw , &
346                                      cnst_fixed_ubc , mw_fac  , ntop_molec , nbot_molec )
348     else
350         kq_scal(:,:) = 0._r8
351         cd_top(:)    = 0._r8
352         cc_top(:)    = 0._r8
354     endif
356     !---------------------------- !
357     ! Diffuse Horizontal Momentum !
358     !---------------------------- !
360     if( diffuse(fieldlist,'u') .or. diffuse(fieldlist,'v') ) then
362         ! Compute the vertical upward differences of the input u,v for KE dissipation
363         ! at each interface.
364         ! Velocity = 0 at surface, so difference at the bottom interface is -u,v(pver)
365         ! These 'dinp_u, dinp_v' are computed using the non-diffused input wind.
367         do i = 1, ncol
368            dinp_u(i,1) = 0._r8
369            dinp_v(i,1) = 0._r8
370            dinp_u(i,pver+1) = -u(i,pver)
371            dinp_v(i,pver+1) = -v(i,pver)
372         end do
373         do k = 2, pver
374            do i = 1, ncol
375               dinp_u(i,k) = u(i,k) - u(i,k-1)
376               dinp_v(i,k) = v(i,k) - v(i,k-1)
377            end do
378         end do
380        ! -------------------------------------------------------------- !
381        ! Do 'Implicit Surface Stress' treatment for numerical stability !
382        ! in the lowest model layer.                                     !
383        ! -------------------------------------------------------------- !
385        if( do_iss ) then
387          ! Compute surface drag coefficient for implicit diffusion 
388          ! including turbulent turbulent mountain stress. 
390            do i = 1, ncol
391               ws(i)       = max( sqrt( u(i,pver)**2._r8 + v(i,pver)**2._r8 ), wsmin )
392               tau(i)      = sqrt( taux(i)**2._r8 + tauy(i)**2._r8 )
393               ksrfturb(i) = max( tau(i) / ws(i), ksrfmin )
394            end do              
395            ksrf(:ncol) = ksrfturb(:ncol) + ksrftms(:ncol)  ! Do all surface stress ( normal + tms ) implicitly
397          ! Vertical integration of input momentum. 
398          ! This is total horizontal momentum per unit area [ kg*m/s/m2 ] in each column.
399          ! Note (u,v) are the raw input to the PBL scheme, not the
400          ! provisionally-marched ones within the iteration loop of the PBL scheme.  
402            do i = 1, ncol
403               usum_in(i) = 0._r8
404               vsum_in(i) = 0._r8
405               do k = 1, pver
406                  usum_in(i) = usum_in(i) + (1._r8/gravit)*u(i,k)/rpdel(i,k)
407                  vsum_in(i) = vsum_in(i) + (1._r8/gravit)*v(i,k)/rpdel(i,k)
408               end do
409            end do              
411          ! Add residual stress of previous time step explicitly into the lowest
412          ! model layer with a relaxation time scale of 'timeres'.
414            ramda         = ztodt / timeres
415            u(:ncol,pver) = u(:ncol,pver) + tmp1(:ncol)*tauresx(:ncol)*ramda
416            v(:ncol,pver) = v(:ncol,pver) + tmp1(:ncol)*tauresy(:ncol)*ramda
418          ! Vertical integration of momentum after adding explicit residual stress
419          ! into the lowest model layer.
421            do i = 1, ncol
422               usum_mid(i) = 0._r8
423               vsum_mid(i) = 0._r8
424               do k = 1, pver
425                  usum_mid(i) = usum_mid(i) + (1._r8/gravit)*u(i,k)/rpdel(i,k)
426                  vsum_mid(i) = vsum_mid(i) + (1._r8/gravit)*v(i,k)/rpdel(i,k)
427               end do
428            end do              
430          ! Debug 
431          ! icol = phys_debug_col(lchnk) 
432          ! if ( icol > 0 .and. get_nstep() .ge. 1 ) then
433          !      tauresx_in = tauresx(icol)
434          !      tauresy_in = tauresy(icol)
435          !      u_in  = u(icol,pver) - tmp1(icol) * tauresx(icol) * ramda
436          !      v_in  = v(icol,pver) - tmp1(icol) * tauresy(icol) * ramda
437          !      u_res = u(icol,pver)
438          !      v_res = v(icol,pver)
439          ! endif
440          ! Debug
442        else
444          ! In this case, do 'turbulent mountain stress' implicitly, 
445          ! but do 'normal turbulent stress' explicitly.
446          ! In this case, there is no 'redisual stress' as long as 'tms' is
447          ! treated in a fully implicit wway, which is true.
449          ! 1. Do 'tms' implicitly
451            ksrf(:ncol) = ksrftms(:ncol) 
453          ! 2. Do 'normal stress' explicitly
455            u(:ncol,pver) = u(:ncol,pver) + tmp1(:ncol)*taux(:ncol)
456            v(:ncol,pver) = v(:ncol,pver) + tmp1(:ncol)*tauy(:ncol)
458        end if  ! End of 'do iss' ( implicit surface stress )
460        ! --------------------------------------------------------------------------------------- !
461        ! Diffuse horizontal momentum implicitly using tri-diagnonal matrix.                      !
462        ! The 'u,v' are input-output: the output 'u,v' are implicitly diffused winds.             !
463        !    For implicit 'normal' stress : ksrf = ksrftms + ksrfturb,                            !
464        !                                   u(pver) : explicitly include 'redisual normal' stress !
465        !    For explicit 'normal' stress : ksrf = ksrftms                                        !
466        !                                   u(pver) : explicitly include 'normal' stress          !                                              
467        ! Note that in all the two cases above, 'tms' is fully implicitly treated.                !
468        ! --------------------------------------------------------------------------------------- !
470        call vd_lu_decomp( pcols , pver , ncol  ,                        &
471                           ksrf  , kvm  , tmpi2 , rpdel , ztodt , zero , &
472                           ca    , cc   , dnom  , tmpm  , ntop  , nbot )
474        call vd_lu_solve(  pcols , pver , ncol  ,                        &
475                           u     , ca   , tmpm  , dnom  , ntop  , nbot , zero )
477        call vd_lu_solve(  pcols , pver , ncol  ,                        &
478                           v     , ca   , tmpm  , dnom  , ntop  , nbot , zero )
480        ! ---------------------------------------------------------------------- !
481        ! Calculate 'total' ( tautotx ) and 'tms' ( tautmsx ) stresses that      !
482        ! have been actually added into the atmosphere at the current time step. ! 
483        ! Also, update residual stress, if required.                             !
484        ! ---------------------------------------------------------------------- !
486        do i = 1, ncol
488           ! Compute the implicit 'tms' using the updated winds.
489           ! Below 'tautmsx(i),tautmsy(i)' are pure implicit mountain stresses
490           ! that has been actually added into the atmosphere both for explicit
491           ! and implicit approach. 
493           tautmsx(i) = -ksrftms(i)*u(i,pver)
494           tautmsy(i) = -ksrftms(i)*v(i,pver)
496           if( do_iss ) then
498             ! Compute vertical integration of final horizontal momentum
500               usum_out(i) = 0._r8
501               vsum_out(i) = 0._r8
502               do k = 1, pver
503                  usum_out(i) = usum_out(i) + (1._r8/gravit)*u(i,k)/rpdel(i,k)
504                  vsum_out(i) = vsum_out(i) + (1._r8/gravit)*v(i,k)/rpdel(i,k)
505               end do
507             ! Compute net stress added into the atmosphere at the current time step.
508             ! Note that the difference between 'usum_in' and 'usum_out' are induced
509             ! by 'explicit residual stress + implicit total stress' for implicit case, while
510             ! by 'explicit normal   stress + implicit tms   stress' for explicit case. 
511             ! Here, 'tautotx(i)' is net stress added into the air at the current time step.
513               tauimpx(i) = ( usum_out(i) - usum_in(i) ) / ztodt
514               tauimpy(i) = ( vsum_out(i) - vsum_in(i) ) / ztodt
516               tautotx(i) = tauimpx(i) 
517               tautoty(i) = tauimpy(i) 
519             ! Compute redisual stress and update if required.
520             ! Note that the total stress we should have added at the current step is
521             ! the sum of 'taux(i) - ksrftms(i)*u(i,pver) + tauresx(i)'.
523               if( itaures .eq. 1 ) then
524                   tauresx(i) = taux(i) + tautmsx(i) + tauresx(i) - tauimpx(i)
525                   tauresy(i) = tauy(i) + tautmsy(i) + tauresy(i) - tauimpy(i)
526               endif
528           else
530               tautotx(i) = tautmsx(i) + taux(i)
531               tautoty(i) = tautmsy(i) + tauy(i)
532               tauresx(i) = 0._r8
533               tauresy(i) = 0._r8
535           end if  ! End of 'do_iss' routine
537        end do ! End of 'do i = 1, ncol' routine
539      ! Debug 
540      ! icol = phys_debug_col(lchnk) 
541      ! if ( icol > 0 .and. get_nstep() .ge. 1 ) then
542      !      write(iulog,*)
543      !      write(iulog,*)  'diffusion_solver debug'  
544      !      write(iulog,*)
545      !      write(iulog,*)  'u_in, u_res, u_out'
546      !      write(iulog,*)   u_in, u_res, u(icol,pver)
547      !      write(iulog,*)  'tauresx_in, tautmsx, tauimpx(actual), tauimpx(derived), tauresx_out, taux'
548      !      write(iulog,*)   tauresx_in, tautmsx(icol), tauimpx(icol), -ksrf(icol)*u(icol,pver), tauresx(icol), taux(icol)
549      !      write(iulog,*)
550      !      write(iulog,*)  'v_in, v_res, v_out'
551      !      write(iulog,*)   v_in, v_res, v(icol,pver)
552      !      write(iulog,*)  'tauresy_in, tautmsy, tauimpy(actual), tauimpy(derived), tauresy_out, tauy'
553      !      write(iulog,*)   tauresy_in, tautmsy(icol), tauimpy(icol), -ksrf(icol)*v(icol,pver), tauresy(icol), tauy(icol)
554      !      write(iulog,*)
555      !      write(iulog,*)  'itaures, ksrf, ksrfturb, ksrftms'
556      !      write(iulog,*)   itaures, ksrf(icol), ksrfturb(icol), ksrftms(icol)
557      !      write(iulog,*) 
558      ! endif
559      ! Debug
561        ! ------------------------------------ !
562        ! Calculate kinetic energy dissipation !
563        ! ------------------------------------ !       
565      ! Modification : In future, this should be set exactly same as 
566      !                the ones in the convection schemes 
568        ! 1. Compute dissipation term at interfaces
569        !    Note that 'u,v' are already diffused wind, and 'tautotx,tautoty' are 
570        !    implicit stress that has been actually added. On the other hand,
571        !    'dinp_u, dinp_v' were computed using non-diffused input wind.
573      ! Modification : I should check whether non-consistency between 'u' and 'dinp_u'
574      !                is correctly intended approach. I think so.
576        k = pver + 1
577        do i = 1, ncol
578           tmpi1(i,1) = 0._r8
579           tmpi1(i,k) = 0.5_r8 * ztodt * gravit * &
580                        ( (-u(i,k-1) + dinp_u(i,k))*tautotx(i) + (-v(i,k-1) + dinp_v(i,k))*tautoty(i) )
581        end do
583        do k = 2, pver
584           do i = 1, ncol
585              dout_u = u(i,k) - u(i,k-1)
586              dout_v = v(i,k) - v(i,k-1)
587              tmpi1(i,k) = 0.25_r8 * tmpi2(i,k) * kvm(i,k) * &
588                           ( dout_u**2 + dout_v**2 + dout_u*dinp_u(i,k) + dout_v*dinp_v(i,k) )
589           end do
590        end do
592        ! 2. Compute dissipation term at midpoints, add to dry static energy
594        do k = 1, pver
595           do i = 1, ncol
596              dtk(i,k) = ( tmpi1(i,k+1) + tmpi1(i,k) ) * rpdel(i,k)
597              dse(i,k) = dse(i,k) + dtk(i,k)
598           end do
599        end do
601     end if ! End of diffuse horizontal momentum, diffuse(fieldlist,'u') routine
603     !-------------------------- !
604     ! Diffuse Dry Static Energy !
605     !-------------------------- !
607   ! Modification : In future, we should diffuse the fully conservative 
608   !                moist static energy,not the dry static energy.
610     if( diffuse(fieldlist,'s') ) then
612       ! Add counter-gradient to input static energy profiles
614         do k = 1, pver
615            dse(:ncol,k) = dse(:ncol,k) + ztodt * rpdel(:ncol,k) * gravit  *                &
616                                        ( rhoi(:ncol,k+1) * kvh(:ncol,k+1) * cgh(:ncol,k+1) &
617                                        - rhoi(:ncol,k  ) * kvh(:ncol,k  ) * cgh(:ncol,k  ) )
618        end do
620      ! Add the explicit surface fluxes to the lowest layer
622        dse(:ncol,pver) = dse(:ncol,pver) + tmp1(:ncol) * shflx(:ncol)
624      ! Diffuse dry static energy
626        call vd_lu_decomp( pcols , pver , ncol  ,                         &
627                           zero  , kvh  , tmpi2 , rpdel , ztodt , cc_top, &
628                           ca    , cc   , dnom  , tmpm  , ntop  , nbot    )
630        call vd_lu_solve(  pcols , pver , ncol  ,                         &
631                           dse   , ca   , tmpm  , dnom  , ntop  , nbot  , cd_top )
633      ! Calculate flux at top interface
634      
635      ! Modification : Why molecular diffusion does not work for dry static energy in all layers ?
637        if( do_molec_diff ) then
638            topflx(:ncol) =  - kvh(:ncol,ntop_molec) * tmpi2(:ncol,ntop_molec) / (ztodt*gravit) * &
639                             ( dse(:ncol,ntop_molec) - dse_top(:ncol) )
640        end if
642     endif
644     !---------------------------- !
645     ! Diffuse Water Vapor Tracers !
646     !---------------------------- !
648   ! Modification : For aerosols, I need to use separate treatment 
649   !                for aerosol mass and aerosol number. 
651     ! Loop through constituents
653     need_decomp = .true.
655     do m = 1, ncnst
657        if( diffuse(fieldlist,'q',m) ) then
659            ! Add the nonlocal transport terms to constituents in the PBL.
660            ! Check for neg q's in each constituent and put the original vertical
661            ! profile back if a neg value is found. A neg value implies that the
662            ! quasi-equilibrium conditions assumed for the countergradient term are
663            ! strongly violated.
665            qtm(:ncol,:pver) = q(:ncol,:pver,m)
667            do k = 1, pver
668               q(:ncol,k,m) = q(:ncol,k,m) + &
669                              ztodt * rpdel(:ncol,k) * gravit  * ( cflx(:ncol,m) * rrho(:ncol) ) * &
670                            ( rhoi(:ncol,k+1) * kvh(:ncol,k+1) * cgs(:ncol,k+1)                    &
671                            - rhoi(:ncol,k  ) * kvh(:ncol,k  ) * cgs(:ncol,k  ) )
672            end do
673            lqtst(:ncol) = all(q(:ncol,1:pver,m) >= qmincg(m), 2)
674            do k = 1, pver
675               q(:ncol,k,m) = merge( q(:ncol,k,m), qtm(:ncol,k), lqtst(:ncol) )
676            end do
678            ! Add the explicit surface fluxes to the lowest layer
680            q(:ncol,pver,m) = q(:ncol,pver,m) + tmp1(:ncol) * cflx(:ncol,m)
682            ! Diffuse constituents.
684            if( need_decomp ) then
686                call vd_lu_decomp( pcols , pver , ncol  ,                         &
687                                   zero  , kvq  , tmpi2 , rpdel , ztodt , zero  , &
688                                   ca    , cc   , dnom  , tmpm  , ntop  , nbot )
690                if( do_molec_diff ) then
692                  ! Update decomposition in molecular diffusion range, include separation velocity term
694                    status = vd_lu_qdecomp( pcols , pver   , ncol      , cnst_fixed_ubc(m), cnst_mw(m), ubc_mmr(:,m), &
695                                            kvq   , kq_scal, mw_fac(m) , tmpi2            , rpdel     ,               &
696                                            ca    , cc     , dnom      , tmpm             , rhoi      ,               &
697                                            tint  , ztodt  , ntop_molec, nbot_molec       , cd_top )
698                else
699                    need_decomp =  .false.
700                endif
701            end if
703            call vd_lu_solve(  pcols , pver , ncol  ,                         &
704                               q(1,1,m) , ca, tmpm  , dnom  , ntop  , nbot  , cd_top )
705        end if
706     end do
708     return
709   end subroutine compute_vdiff
711   ! =============================================================================== !
712   !                                                                                 !
713   ! =============================================================================== !
715   subroutine vd_lu_decomp( pcols, pver, ncol ,                        &
716                            ksrf , kv  , tmpi , rpdel, ztodt , cc_top, &
717                            ca   , cc  , dnom , ze   , ntop  , nbot    )
718     !---------------------------------------------------------------------- !
719     ! Determine superdiagonal (ca(k)) and subdiagonal (cc(k)) coeffs of the ! 
720     ! tridiagonal diffusion matrix.                                         ! 
721     ! The diagonal elements (1+ca(k)+cc(k)) are not required by the solver. !
722     ! Also determine ze factor and denominator for ze and zf (see solver).  !
723     !---------------------------------------------------------------------- !
725     ! --------------------- !
726     ! Input-Output Argument !
727     ! --------------------- !
729     integer,  intent(in)  :: pcols                 ! Number of allocated atmospheric columns
730     integer,  intent(in)  :: pver                  ! Number of allocated atmospheric levels 
731     integer,  intent(in)  :: ncol                  ! Number of computed atmospheric columns
732     integer,  intent(in)  :: ntop                  ! Top level to operate on
733     integer,  intent(in)  :: nbot                  ! Bottom level to operate on
734     real(r8), intent(in)  :: ksrf(pcols)           ! Surface "drag" coefficient [ kg/s/m2 ]
735     real(r8), intent(in)  :: kv(pcols,pver+1)      ! Vertical diffusion coefficients [ m2/s ]
736     real(r8), intent(in)  :: tmpi(pcols,pver+1)    ! dt*(g/R)**2/dp*pi(k+1)/(.5*(tm(k+1)+tm(k))**2
737     real(r8), intent(in)  :: rpdel(pcols,pver)     ! 1./pdel  (thickness bet interfaces)
738     real(r8), intent(in)  :: ztodt                 ! 2 delta-t [ s ]
739     real(r8), intent(in)  :: cc_top(pcols)         ! Lower diagonal on top interface (for fixed ubc only)
741     real(r8), intent(out) :: ca(pcols,pver)        ! Upper diagonal
742     real(r8), intent(out) :: cc(pcols,pver)        ! Lower diagonal
743     real(r8), intent(out) :: dnom(pcols,pver)      ! 1./(1. + ca(k) + cc(k) - cc(k)*ze(k-1))
744     real(r8), intent(out) :: ze(pcols,pver)        ! Term in tri-diag. matrix system
746     ! --------------- !
747     ! Local Variables !
748     ! --------------- !
750     integer :: i                                   ! Longitude index
751     integer :: k                                   ! Vertical  index
753     ! ----------------------- !
754     ! Main Computation Begins !
755     ! ----------------------- !
757     ! Determine superdiagonal (ca(k)) and subdiagonal (cc(k)) coeffs of the 
758     ! tridiagonal diffusion matrix. The diagonal elements  (cb=1+ca+cc) are
759     ! a combination of ca and cc; they are not required by the solver.
761     do k = nbot - 1, ntop, -1
762        do i = 1, ncol
763           ca(i,k  ) = kv(i,k+1) * tmpi(i,k+1) * rpdel(i,k  )
764           cc(i,k+1) = kv(i,k+1) * tmpi(i,k+1) * rpdel(i,k+1)
765        end do
766     end do
768     ! The bottom element of the upper diagonal (ca) is zero (element not used).
769     ! The subdiagonal (cc) is not needed in the solver.
771     do i = 1, ncol
772        ca(i,nbot) = 0._r8
773     end do
775     ! Calculate e(k).  This term is 
776     ! required in solution of tridiagonal matrix defined by implicit diffusion eqn.
778     do i = 1, ncol
779        dnom(i,nbot) = 1._r8/(1._r8 + cc(i,nbot) + ksrf(i)*ztodt*gravit*rpdel(i,nbot))
780        ze(i,nbot)   = cc(i,nbot)*dnom(i,nbot)
781     end do
783     do k = nbot - 1, ntop + 1, -1
784        do i = 1, ncol
785           dnom(i,k) = 1._r8/(1._r8 + ca(i,k) + cc(i,k) - ca(i,k)*ze(i,k+1))
786           ze(i,k)   = cc(i,k)*dnom(i,k)
787        end do
788     end do
790     do i = 1, ncol
791        dnom(i,ntop) = 1._r8/(1._r8 + ca(i,ntop) + cc_top(i) - ca(i,ntop)*ze(i,ntop+1))
792     end do
794     return
795   end subroutine vd_lu_decomp
797   ! =============================================================================== !
798   !                                                                                 !
799   ! =============================================================================== !
801   subroutine vd_lu_solve( pcols , pver , ncol , &
802                           q     , ca   , ze   , dnom , ntop , nbot , cd_top )
803     !----------------------------------------------------------------------------------- !
804     ! Solve the implicit vertical diffusion equation with zero flux boundary conditions. !
805     ! Procedure for solution of the implicit equation follows Richtmyer and              !
806     ! Morton (1967,pp 198-200).                                                          !
807     !                                                                                    !
808     ! The equation solved is                                                             !
809     !                                                                                    !  
810     !     -ca(k)*q(k+1) + cb(k)*q(k) - cc(k)*q(k-1) = d(k),                              !
811     !                                                                                    !
812     ! where d(k) is the input profile and q(k) is the output profile                     !
813     !                                                                                    ! 
814     ! The solution has the form                                                          !
815     !                                                                                    !
816     !     q(k) = ze(k)*q(k-1) + zf(k)                                                    !
817     !                                                                                    !
818     !     ze(k) = cc(k) * dnom(k)                                                        !
819     !                                                                                    !  
820     !     zf(k) = [d(k) + ca(k)*zf(k+1)] * dnom(k)                                       !
821     !                                                                                    !
822     !     dnom(k) = 1/[cb(k) - ca(k)*ze(k+1)] =  1/[1 + ca(k) + cc(k) - ca(k)*ze(k+1)]   !
823     !                                                                                    !
824     ! Note that the same routine is used for temperature, momentum and tracers,          !
825     ! and that input variables are replaced.                                             !
826     ! ---------------------------------------------------------------------------------- ! 
828     ! --------------------- !
829     ! Input-Output Argument !
830     ! --------------------- !
832     integer,  intent(in)    :: pcols                  ! Number of allocated atmospheric columns
833     integer,  intent(in)    :: pver                   ! Number of allocated atmospheric levels 
834     integer,  intent(in)    :: ncol                   ! Number of computed atmospheric columns
835     integer,  intent(in)    :: ntop                   ! Top level to operate on
836     integer,  intent(in)    :: nbot                   ! Bottom level to operate on
837     real(r8), intent(in)    :: ca(pcols,pver)         ! -Upper diag coeff.of tri-diag matrix
838     real(r8), intent(in)    :: ze(pcols,pver)         ! Term in tri-diag solution
839     real(r8), intent(in)    :: dnom(pcols,pver)       ! 1./(1. + ca(k) + cc(k) - ca(k)*ze(k+1))
840     real(r8), intent(in)    :: cd_top(pcols)          ! cc_top * ubc value
842     real(r8), intent(inout) :: q(pcols,pver)          ! Constituent field
844     ! --------------- !
845     ! Local Variables ! 
846     ! --------------- !
848     real(r8)                :: zf(pcols,pver)         ! Term in tri-diag solution
849     integer                    i, k                   ! Longitude, vertical indices
851     ! ----------------------- !
852     ! Main Computation Begins !
853     ! ----------------------- !
855     ! Calculate zf(k). Terms zf(k) and ze(k) are required in solution of 
856     ! tridiagonal matrix defined by implicit diffusion equation.
857     ! Note that only levels ntop through nbot need be solved for.
859     do i = 1, ncol
860        zf(i,nbot) = q(i,nbot)*dnom(i,nbot)
861     end do
863     do k = nbot - 1, ntop + 1, -1
864        do i = 1, ncol
865           zf(i,k) = (q(i,k) + ca(i,k)*zf(i,k+1))*dnom(i,k)
866        end do
867     end do
869     ! Include boundary condition on top element
871     k = ntop
872     do i = 1, ncol
873        zf(i,k) = (q(i,k) + cd_top(i) + ca(i,k)*zf(i,k+1))*dnom(i,k)
874     end do
876     ! Perform back substitution
878     do i = 1, ncol
879        q(i,ntop) = zf(i,ntop)
880     end do
882     do k = ntop + 1, nbot, +1
883        do i = 1, ncol
884           q(i,k) = zf(i,k) + ze(i,k)*q(i,k-1)
885        end do
886     end do
888     return
889   end subroutine vd_lu_solve
891   ! =============================================================================== !
892   !                                                                                 !
893   ! =============================================================================== !
894   
895   character(128) function vdiff_select( fieldlist, name, qindex )
896     ! --------------------------------------------------------------------- !
897     ! This function sets the field with incoming name as one to be diffused !
898     ! --------------------------------------------------------------------- !
899     type(vdiff_selector), intent(inout)        :: fieldlist
900     character(*),         intent(in)           :: name
901     integer,              intent(in), optional :: qindex
902     
903     vdiff_select = ''
904     select case (name)
905     case ('u','U')
906        fieldlist%fields(1) = .true.
907     case ('v','V')
908        fieldlist%fields(2) = .true.
909     case ('s','S')
910        fieldlist%fields(3) = .true.
911     case ('q','Q')
912        if( present(qindex) ) then
913            fieldlist%fields(3 + qindex) = .true.
914        else
915            fieldlist%fields(4) = .true.
916        endif
917     case default
918        write(vdiff_select,*) 'Bad argument to vdiff_index: ', name
919     end select
920     return
921     
922   end function vdiff_select
924   type(vdiff_selector) function not(a)
925     ! ------------------------------------------------------------- !
926     ! This function extends .not. to operate on type vdiff_selector !
927     ! ------------------------------------------------------------- !    
928     type(vdiff_selector), intent(in)  :: a
929     allocate(not%fields(size(a%fields)))
930     not%fields(:) = .not. a%fields(:)
931   end function not
933   logical function my_any(a)
934     ! -------------------------------------------------- !
935     ! This function extends the intrinsic function 'any' ! 
936     ! to operate on type vdiff_selector                  ! 
937     ! -------------------------------------------------- !
938     type(vdiff_selector), intent(in) :: a
939     my_any = any(a%fields)
940   end function my_any
942   logical function diffuse(fieldlist,name,qindex)
943     ! ---------------------------------------------------------------------------- !
944     ! This function reports whether the field with incoming name is to be diffused !
945     ! ---------------------------------------------------------------------------- !
946     type(vdiff_selector), intent(in)           :: fieldlist
947     character(*),         intent(in)           :: name
948     integer,              intent(in), optional :: qindex
949     
950     select case (name)
951     case ('u','U')
952        diffuse = fieldlist%fields(1)
953     case ('v','V')
954        diffuse = fieldlist%fields(2)
955     case ('s','S')
956        diffuse = fieldlist%fields(3)
957     case ('q','Q')
958        if( present(qindex) ) then
959            diffuse = fieldlist%fields(3 + qindex)
960        else
961            diffuse = fieldlist%fields(4)
962        endif
963     case default
964        diffuse = .false.
965     end select
966     return
967   end function diffuse
969 end module diffusion_solver