1 #~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
2 # User: Set here the F90 compiler and options
3 # Pedefined compilers: INTEL, PGF, HPUX, LAHEY
4 #~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
13 FOPT_GNU = -cpp -O -pg -fbounds-check
15 FOPT_LAHEY = -Cpp --pca
16 #FOPT_LAHEY = -Cpp --chk a,e,s,u --pca --ap -O0 -g --trap
18 FOPT_INTEL = -cpp -O -mp -pc80 -prec_div -tpp7 -implicitnone
20 FOPT_PGF = -Mpreprocess -O -fast -pc 80 -Kieee
22 FOPT_HPUX = -O -u +Oall +check=on
24 # define FULL_ALGEBRA for non-sparse integration
25 FC = $(FC_$(COMPILER))
26 FOPT = $(FOPT_$(COMPILER)) # -DFULL_ALGEBRA
29 #LIBS = -llapack -lblas
31 # Command to create Matlab mex gateway routines
32 # Note: use $(FC) as the mex Fortran compiler
35 GENSRC = small_strato_Precision.f90 \
36 small_strato_Parameters.f90 \
37 small_strato_Global.f90
39 GENOBJ = small_strato_Precision.o \
40 small_strato_Parameters.o \
43 FUNSRC = small_strato_Function.f90
44 FUNOBJ = small_strato_Function.o
46 JACSRC = small_strato_JacobianSP.f90 small_strato_Jacobian.f90
47 JACOBJ = small_strato_JacobianSP.o small_strato_Jacobian.o
49 HESSRC = small_strato_HessianSP.f90 small_strato_Hessian.f90
50 HESOBJ = small_strato_HessianSP.o small_strato_Hessian.o
52 STMSRC = small_strato_StoichiomSP.f90 small_strato_Stoichiom.f90
53 STMOBJ = small_strato_StoichiomSP.o small_strato_Stoichiom.o
55 UTLSRC = small_strato_Rates.f90 small_strato_Util.f90 small_strato_Monitor.f90
56 UTLOBJ = small_strato_Rates.o small_strato_Util.o small_strato_Monitor.o
58 LASRC = small_strato_LinearAlgebra.f90
59 LAOBJ = small_strato_LinearAlgebra.o
61 STOCHSRC = small_strato_Stochastic.f90
62 STOCHOBJ = small_strato_Stochastic.o
64 MAINSRC = small_strato_Main.f90 small_strato_Initialize.f90 small_strato_Integrator.f90 small_strato_Model.f90
65 MAINOBJ = small_strato_Main.o small_strato_Initialize.o small_strato_Integrator.o small_strato_Model.o
67 #~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
68 # User: modify the line below to include only the
69 # objects needed by your application
70 #~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
71 ALLOBJ = $(GENOBJ) $(FUNOBJ) $(JACOBJ) $(HESOBJ) $(STMOBJ) \
74 #~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
75 # User: modify the line below to include only the
76 # executables needed by your application
77 #~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
80 exe: $(ALLOBJ) $(MAINOBJ)
81 $(FC) $(FOPT) $(ALLOBJ) $(MAINOBJ) $(LIBS) -o small_strato.exe
83 stochastic:$(ALLOBJ) $(STOCHOBJ) $(MAINOBJ)
84 $(FC) $(FOPT) $(ALLOBJ) $(STOCHOBJ) $(MAINOBJ) $(LIBS) \
85 -o small_strato_stochastic.exe
88 $(MEX) FC#$(FC) -fortran -O small_strato_mex_Fun.f90 $(ALLOBJ)
89 $(MEX) FC#$(FC) -fortran -O small_strato_mex_Jac_SP.f90 $(ALLOBJ)
90 $(MEX) FC#$(FC) -fortran -O small_strato_mex_Hessian.f90 $(ALLOBJ)
93 rm -f small_strato*.o small_strato*.mod \
94 small_strato*.dat small_strato.exe small_strato*.mexglx \
98 rm -f small_strato*.o small_strato*.mod \
99 small_strato*.dat small_strato.exe small_strato.map \
100 small_strato*.f90 small_strato_*.mexglx
102 small_strato_Precision.o: small_strato_Precision.f90
105 small_strato_Parameters.o: small_strato_Parameters.f90 \
106 small_strato_Precision.o
109 small_strato_Monitor.o: small_strato_Monitor.f90 \
110 small_strato_Precision.o
113 small_strato_Global.o: small_strato_Global.f90 \
114 small_strato_Parameters.o small_strato_Precision.o
117 small_strato_Initialize.o: small_strato_Initialize.f90 $(GENOBJ)
120 small_strato_Function.o: small_strato_Function.f90 $(GENOBJ)
123 small_strato_Stochastic.o: small_strato_Stochastic.f90 $(GENOBJ)
126 small_strato_JacobianSP.o: small_strato_JacobianSP.f90 $(GENOBJ)
129 small_strato_Jacobian.o: small_strato_Jacobian.f90 $(GENOBJ) small_strato_JacobianSP.o
132 small_strato_LinearAlgebra.o: small_strato_LinearAlgebra.f90 $(GENOBJ) small_strato_JacobianSP.o
135 small_strato_Rates.o: small_strato_Rates.f90 $(GENOBJ)
138 small_strato_HessianSP.o: small_strato_HessianSP.f90 $(GENOBJ)
141 small_strato_Hessian.o: small_strato_Hessian.f90 $(GENOBJ) small_strato_HessianSP.o
144 small_strato_StoichiomSP.o: small_strato_StoichiomSP.f90 $(GENOBJ)
147 small_strato_Stoichiom.o: small_strato_Stoichiom.f90 $(GENOBJ) small_strato_StoichiomSP.o
150 small_strato_Util.o: small_strato_Util.f90 $(GENOBJ) small_strato_Monitor.o
153 small_strato_Main.o: small_strato_Main.f90 $(ALLOBJ) small_strato_Initialize.o small_strato_Model.o small_strato_Integrator.o
156 small_strato_Model.o: small_strato_Model.f90 $(ALLOBJ) small_strato_Integrator.o
159 small_strato_Integrator.o: small_strato_Integrator.f90 $(ALLOBJ)